tablecode(seqinr)
tablecode()所属R语言包:seqinr
to plot genetic code as in textbooks
在教科书中绘制遗传密码
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This function plots a genetic code table as in textbooks, that is following the order T > C > A > G so that synonymous codons are almost always in the same boxes.
此功能教科书中,这是继顺序绘制遗传密码表T > C > A > G同义密码子几乎都是在同一盒。
用法----------Usage----------
tablecode(numcode = 1, urn.rna = s2c("TCAG"), dia = FALSE, latexfile = NULL,
label = latexfile, size = "normalsize", caption = NULL,
preaa = rep("", 64), postaa = rep("", 64),
precodon = preaa, postcodon = postaa)
参数----------Arguments----------
参数:numcode
The genetic code number as in translate
遗传密码如translate
参数:urn.rna
The letters to display codons, use s2c("UCAG") if you want the code in terms of RNA sequence
显示密码子的字母,如果你想使用S2C(“UCAG”)的RNA序列中的代码
参数:latexfile
The name of a LaTex file if you want to redirect the output
LaTeX文件的名称,如果你想将输出重定向
参数:label
The label for the LaTeX table
LaTeX的表的标签
参数:size
The LaTex size of characters for the LaTeX table
乳胶的乳胶表中的字符大小
参数:preaa
A string to insert before the amino-acid in the LaTeX table
LaTeX的表中插入的字符串之前的氨基酸
参数:postaa
A string to insert after the amino-acid in the LaTeX table
LaTeX的表中插入的字符串后的氨基酸
参数:precodon
A string to insert before the codon in the LaTeX table
LaTeX的表中插入的字符串的密码子前
参数:postcodon
A string to insert after the codon in the LaTeX table
的密码子后的LaTeX的表中插入的字符串
参数:caption
The caption of the LaTeX table
LaTeX的表的标题
参数:dia
to produce a yellow/blue plot for slides
产生黄色/蓝色曲线为幻灯片
Details
详细信息----------Details----------
The codon order for preaa, postaa, precodon, and postcodon should be the same as in paste(paste(rep(s2c("tcag"), each =16), s2c("tcag"), sep = ""), rep(s2c("tcag"), each = 4), sep = "")
为了preaa,postaa,precodon和postcodon应该是一样的paste(paste(rep(s2c("tcag"), each =16), s2c("tcag"), sep = ""), rep(s2c("tcag"), each = 4), sep = "")密码
(作者)----------Author(s)----------
J.R. Lobry
参考文献----------References----------
参见----------See Also----------
translate, syncodons
translate,syncodons
实例----------Examples----------
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# Show me the standard genetic code:[我的标准的遗传密码:]
#[]
tablecode()
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注:
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注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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