getCountsInWindow(seqCBS)
getCountsInWindow()所属R语言包:seqCBS
Get number of reads in fixed-width window
读取数固定宽度的窗口
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Computes the number of reads for each fixed-width window between two limits
计算每一个固定宽度的窗口在两个极限之间的读取数量
用法----------Usage----------
getCountsInWindow(events, startE, endE, windowSize = 10000, sorted = FALSE)
参数----------Arguments----------
参数:events
A vector of the read positions
读位置的矢量
参数:startE
Left limit
左极限
参数:endE
Right Limit
右极限
参数:windowSize
Size of the window
窗口的大小
参数:sorted
Whether events is sorted, default F
无论是事件排序,默认F
Details
详细信息----------Details----------
Uses hist() function
使用hist()函数
值----------Value----------
A vector of counts for each window
每个窗口的矢量计数
(作者)----------Author(s)----------
Jeremy J. Shen
参见----------See Also----------
ScanCBS
ScanCBS
实例----------Examples----------
getCountsInWindow(sample(1:10000, 3000, replace=TRUE), 0, 10000, 100, FALSE)
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