R语言 altcdfenvs包 removeIndex()函数中文帮助文档(中英文对照)

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removeIndex(altcdfenvs)
removeIndex()所属R语言包：altcdfenvs

                                         A function to remove probes in an environment
                                         函数的环境中删除的探针

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

A function to remove probes in an environment, given their index.
函数，以消除环境探测，其指数。


用法----------Usage----------


removeIndex(x, i, simplify = TRUE, verbose = FALSE)



参数----------Arguments----------

参数：x
An instance of CdfEnvAffy-class  
一个CdfEnvAffy-class的实例


参数：i
A vector of indexes (integers !).  
向量的索引（整数）。


参数：simplify
Simply the resulting CdfEnvAffy (see details).  
简单的结果CdfEnvAffy（见详情）。


参数：verbose
verbose output or not.  
或不详细的输出。


Details

详情----------Details----------

The probes to be removed are set to NA in the CdfEnvAffy. When simplify is set to TRUE the probe sets are simplified whenever possible. For example, if both pm and mm for the same probe pair are set to NA, then the probe pair is removed from the probe set.
NACdfEnvAffy在要删除的探针设置。当simplify设置为TRUE探针集尽可能简化。例如，如果下午毫米相同的探针对被设置为NA，然后探针对从探针组中删除。


值----------Value----------

An instance of CdfEnvAffy-class is returned.
CdfEnvAffy-class的一个实例被返回。


作者（S）----------Author(s)----------


Laurent Gautier



参见----------See Also----------

CdfEnvAffy-class
CdfEnvAffy-class


举例----------Examples----------



## use plasmodiumanopheles chip as an example[＃使用plasmodiumanopheles芯片为例]
if (require(plasmodiumanophelescdf)) {

  ## wrap in a (convenient) CdfEnvAffy object[＃包装（方便）CdfEnvAffy对象]
  planocdf <- wrapCdfEnvAffy(plasmodiumanophelescdf, 712, 712, "plasmodiumanophelescdf")
  print(planocdf)

  ## ask for the probe indexed '10759' to be removed[＃问探针索引10759被删除]
  ## (note: if one wishes to remove from X/Y coordinates,[＃（注：如果一个人希望从X / Y坐标，]
  ## the function xy2index can be of help).[＃的功能xy2index可以有所帮助）。]
  planocdfCustom <- removeIndex(planocdf, as.integer(10759))

  ## let see what happened (we made this example knowing in which[＃让我们看看发生了什么（我们知道在这个例子]
  ## probe set the probe indexed '10759' is found).[＃探针设置探针索引10759被发现）。]
  indexProbes(planocdf, "pm", "200000_s_at")
  indexProbes(planocdfCustom, "pm", "200000_s_at")
  ## The 'second' pm probe (indexed '10579') in the probe set is now set[＃第二时探针（索引10579）在探针集现在设置]
  ## to NA.[＃NA。]
}


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