R语言 altcdfenvs包 getxy.probeseq()函数中文帮助文档(中英文对照)

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getxy.probeseq(altcdfenvs)
getxy.probeseq()所属R语言包：altcdfenvs

                                         A function to get the XY coordinates from a probes sequences
                                         函数得到的XY坐标从探针序列

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

A function to get the XY coordinates from a probes sequences data.frame
函数得到的XY坐标，从1探针序列data.frame


用法----------Usage----------


getxy.probeseq(ppset.id = NULL, probeseq = NULL, i.row = NULL,
xy.offset = NULL, x.colname = "x", y.colname = "y")



参数----------Arguments----------

参数：ppset.id
The probe sets of interest (a vector of mode character.  
感兴趣的探针台（一个模式character向量。


参数：probeseq
The probe sequence data.frame (see details).  
探针序列data.frame（见详情）。


参数：i.row
Row indexes in the data.frame (see details).  
data.frame（见详情）排索引。


参数：xy.offset
Offset for the xy coordinates. if NULL, uses the default offset stored as an option for the affy package.  
xy坐标的偏移量。如果NULL，使用默认的偏移量作为一个选项存储为affy包。


参数：x.colname, y.colname
The probe sequence packages have seen the names for the columns in their data.frame. This parameters exists to let us follow these changes.
探针序列软件包已经看到他们data.frame列的名称。此参数的存在，让我们跟随这些变化。


Details

详情----------Details----------

The data.frame passed as argument probeseq is expected to have (at least) the following columns: Probe.X, Probe.Y and Probe.Set.Name. When the argument ppset.id is not null, the probe sets
data.frame传递参数probeseq预计将有至少以下几列：Probe.X，Probe.Y和Probe.Set.Name。当参数ppset.id不为空，设置探针


值----------Value----------

A matrix of two columns. The first column contains x coordinates, while the second column contains y coordinates.
一个matrix两列。第一列包含x坐标，而第二列包含y坐标。


警告----------Warning ----------

The parameter xy.offset.one is here for historical reasons. This should not be touched, the option in the affy package should be modified if one wishes to modify this.
参数xy.offset.one这里是历史原因。这不应该被感动，在选项的affy包应该被修改，如果一个愿望修改。

This function should not be confused with the methods index2xy and similar. Here the the XY coordinate come from a data.frame that stores information about an arbitrary number probes on the chip. (See the "probe sequence" data packages on Bioconductor, and the package Biostrings).
此功能不应该混淆与index2xy和类似的方法。这里的XY坐标来自data.frame信息存储，一个芯片上的任意数量的探测器。 （见Bioconductor“探针序列”数据包，包Biostrings）。

The methods index2xy are meant to interact with instances of class AffyBatch.
方法index2xy类AffyBatch的实例是为了互动。


作者（S）----------Author(s)----------


Laurent



举例----------Examples----------


##---- Should be DIRECTLY executable !! ----[＃----应直接执行！！ ----]

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注：
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