cdfenvs(altcdfenvs)
cdfenvs()所属R语言包:altcdfenvs
functions related to cdfenvs
相关的函数来cdfenvs
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
A set of functions to handle cdfenvs
一组函数来处理cdfenvs
用法----------Usage----------
wrapCdfEnvAffy(cdfenv, nrow.chip, ncol.chip, chiptype, check = TRUE,
verbose = FALSE)
getCdfEnvAffy(abatch)
buildCdfEnv.matchprobes(matches, ids, probes.pack, abatch=NULL,
nrow.chip=NULL, ncol.chip=NULL, chiptype=NULL,
mm=NA, simplify = TRUE,
x.colname = "x", y.colname = "y", verbose=FALSE)
参数----------Arguments----------
参数:abatch
an AffyBatch
AffyBatch
参数:cdfenv
A cdfenv environment
一个cdfenv环境
参数:check
perform consistency check or not
执行一致性检查,或不
参数:chiptype
A name for the chip type
芯片类型的名称
参数:ids
a vector of probe set identifiers for the matches
比赛的探针集标识符的向量
参数:matches
a list as returned by the function combineAffyBatch
功能combineAffyBatch返回列表
参数:mm
The value to store for MMs
值存储MMS
参数:ncol.chip
The number of columns for the chip type
芯片类型的列数
参数:nrow.chip
The number of rows for the chip type
芯片类型的行数
参数:probes.pack
The name of the probe package
探针包的名称
参数:simplify
Simplify the environment created by removing the ids without any matching probe
简化删除的ID创建环境没有任何匹配的探针
参数:x.colname, y.colname
see the getxy.probeseq
getxy.probeseq
参数:verbose
verbosity (TRUE or FALSE)
冗长(TRUE或FALSE)
值----------Value----------
An instance of class CdfEnvAffy.
实例类CdfEnvAffy。
举例----------Examples----------
## See the main vignette[#请参阅主要的小插曲]
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