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R语言 selectiongain包 matrix.x()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-9-30 00:26:14 | 显示全部楼层 |阅读模式
matrix.x(selectiongain)
matrix.x()所属R语言包:selectiongain

                                        Matrix X
                                         矩阵X

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Function to obtain a matrix containing trait-weighted species composition. For more details, see syncsa.
函数来获得一个矩阵的特征加权的物种组成。有关详细信息,请参阅syncsa。


用法----------Usage----------


matrix.x(comm, traits, scale = TRUE)



参数----------Arguments----------

参数:comm
Community data, with species as columns and sampling units as rows. This matrix can contain either presence/absence or abundance data.
社区数据,列和行的抽样单位的物种。这个矩阵可以包含存在/不存在或丰度数据。


参数:traits
Matrix data of species described by traits, with traits as columns and species as rows.
矩阵数据的物种所描述的特征,列和行的物种性状。


参数:scale
Logical argument (TRUE or FALSE) to specify if the traits are measured on different scales (Default Scale = TRUE). Scale = TRUE if traits are measured on different scales, the matrix of traits is subjected to standardization within each trait, and  Gower Index is used to calculate the degree of belonging to the species. Scale = FALSE if traits are measured on the same scale, the matrix of traits is not subjected to standardization, and Euclidean distance is calculated to determine the degree of belonging to the species.
逻辑参数(TRUE或FALSE)指定的特性测量不同尺度上(默认的比例= TRUE)。量程= TRUE如果在不同尺度计量性状,性状矩阵进行标准化内各性状,高尔指数是用来计算属于该物种的程度。规模= FALSE,如果性状测量在相同的规模,矩阵的特征是不会受到标准化,欧氏距离计算,以确定属于该物种的程度。


值----------Value----------


参数:matriz.w
Standardized community matrix, where rows are communities and columns species. Row totals (communities) = 1.
标准化社区矩阵,其中行是社区和列的品种。行总计(社区)= 1。


参数:matriz.u
Standardized matrix containing the degree of belonging of each species in relation to each other species. Row totals (species) = 1.
标准化的基质中含有的程度属于每一个物种在彼此的物种。行总数(种)= 1。


参数:matriz.X
Trait-weighted species composition matrix. Row totals (communities) = 1.
特质加权物种组成的矩阵。行总计(社区)= 1。


警告----------Warning----------

Input data must  be of class matrix (Tip: use function as.matrix to transform the data frame).
输入数据必须是类矩阵(提示:使用的功能as.matrix转换的数据框)。

<STRONG>IMPORTANT</STRONG>: The sequence species show up in community data matrix MUST be the same as they show up in traits matrix. See organize.syncsa.
<strong>重要提示</ STRONG>:序列的物种出现在社区数据矩阵必须是相同的,因为它们显示在特征矩阵。见organize.syncsa。


(作者)----------Author(s)----------



Vanderlei J煤lio Debastiani &lt;vanderleidebastiani@yahoo.com.br&gt;




参考文献----------References----------




参见----------See Also----------

matrix.t, matrix.p, syncsa, organize.syncsa  
matrix.t,matrix.p,syncsa,organize.syncsa


实例----------Examples----------


data(flona)
matrix.x(flona$community,flona$traits,scale=TRUE)

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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