SPACECAP(secr)
SPACECAP()所属R语言包：secr
Exchange data with SPACECAP package
交换数据SPACECAP包
译者：生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Data in a single-session secr capthist object may be written directly to the "csv" format used by SPACECAP, a package for Bayesian spatially explicit capture–recapture (Singh et al. 2010). Data in csv format may also be read to construct a capthist object for analysis in secr.
在一个单一的会话数据secrcapthist对象可以直接写到“CSV”SPACECAP，包贝叶斯空间明确的捕获 - 再捕获（Singh等人使用的格式。 2010）。 csv格式的数据也可以被理解为建立一个capthist分析对象，在secr。
用法----------Usage----------
write.SPACECAP(object, mask = NULL, buffer = 100, ndec = 2,
filestem = "")
read.SPACECAP(AC, TD, detector = "proximity", session = "1")
参数----------Arguments----------
参数：object
capthist object with the captures and trap locations to export
capthist对象的捕捉和陷阱的位置，以便出口
参数：mask
mask object to use for state-space file
mask反对使用状态空间文件
参数：buffer
width of buffer in metres to use when creating a mask if none is specified
缓冲区的宽度，以米为单位使用时，如果没有指定，创建遮罩
参数：ndec
number of digits after decimal point for coordinates of mask on output
面膜输出坐标小数点后的位数
参数：filestem
character value used to form names of output files
使用的字符值形成的输出文件的名称
参数：AC
character value giving name of "animal capture" .csv file
csv文件字符值提供“动物捕获”的名称。
参数：TD
character value giving name of "trap deployment" .csv file
csv文件字符值的名称“陷阱部署”。
参数：detector
detector type ("proximity" or "count")
检测器类型（“接近性”或“计数”）
参数：session
character value to use as session name
使用会话名称的字符值
Details
详细信息----------Details----------
If successful, write.SPACECAP creates three output files with names ending in "AC.csv","TD.csv" and "SS.csv". These are respectively the "Animal Capture", "Trap Deployment" and "State-Space" files required by SPACECAP.
如果成功的话，write.SPACECAP创建三个输出文件名称在“AC.csv”，“TD.csv”和“SS.csv的结束。这些分别是“动物捕捉”，“陷阱部署”和“国家空间的文件所要求的SPACECAP。
值----------Value----------
write.SPACECAP is used for its side effect of writing the required csv files. read.SPACECAP returns a capthist object.
write.SPACECAP用于其副作用的写入需要的csv文件。 read.SPACECAP返回一个capthist对象。
注意----------Note----------
State-space csv files may be imported with read.mask.
国家空间csv文件可以进口与read.mask。
参考文献----------References----------
K. U. (2010) SPACECAP: A program to estimate animal abundance and density using Bayesian spatially explicit capture-recapture models. Version 1.0. Wildlife Conservation Society - India Program, Centre for Wildlife Studies, Bangalure, India.
参见----------See Also----------
capthist, mask, read.mask
capthist，mask，read.mask
实例----------Examples----------
## Not run: [＃不运行：]
## coerce data to proximity detector type for export[＃接近检测器出口类型的数据强制]
demo <- reduce(captdata, output = "proximity")
write.SPACECAP (demo, filestem = "demo")
## now read back the data just exported...[＃现在读回刚才导出的数据...]
temp <- read.SPACECAP ("demoAC.csv", "demoTD.csv")
temp <- reduce(temp, output = "single")
summary (temp)
summary (captdata)
## should match exactly[＃完全匹配]
identical(summary(temp), summary(captdata))
## End(Not run)[＃（不执行）]
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发表于 2012-9-30 00:05:33
