mvaBASIC(AgiMicroRna)
mvaBASIC()所属R语言包:AgiMicroRna
MVA plot
MVA的图
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
For each array, the M value is computed for every spot as the difference between the spot intensity in the array and the averaged intensity for that feature over the whole set of arrays. It does not make a distintion between the different kind of features in the array as the mvaMicroRna() does.
对于每一个阵列,M值计算每个数组中的点强度和平均强度的超过阵列一整套功能之间的差异点。它不会使distintion之间的不同类型的功能,在阵列作为的mvaMicroRna()。
用法----------Usage----------
mvaBASIC(object, colorfill, maintitle)
参数----------Arguments----------
参数:object
An expression matrix in log2 scale
以log2规模的表达矩阵
参数:colorfill
color of the plot
颜色的图
参数:maintitle
title of the plot
图称号
作者(S)----------Author(s)----------
Pedro Lopez-Romero
举例----------Examples----------
data(dd.micro)
op=par(mfrow=c(1,1),ask=TRUE)
mvaBASIC(log2(dd.micro$meanS),
colorfill="red",
maintitle=" log2 Mean Signal")
par(op)
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