R语言 AgiMicroRna包 cvArray()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

cvArray(AgiMicroRna)
cvArray()所属R语言包：AgiMicroRna

                                         Coefficient of variation of replicated probes within array
                                         复制探针阵列内变异系数

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Identifies replicated features at probe and at gene level and  computes the coefficient of variation of the array
探针和基因水平的标识复制功能和计算数组的变异系数


用法----------Usage----------


cvArray(ddDUP, foreground = c("MeanSignal", "ProcessedSignal"),targets,verbose=FALSE)



参数----------Arguments----------

参数：ddDUP
uRNAList, containing the output from readMicroRnaAFE   
uRNAList，包含从readMicroRnaAFE输出


参数：foreground
Specifies the signal used, only "MeanSignal" or "ProcessedSignal" can be used
指定使用的信号，只有“MeanSignal”或“”可用于ProcessedSignal


参数：targets
data.frame with the target structure   
数据框与目标结构


参数：verbose
logical, if TRUE prints out output        
逻辑，如果TRUE打印出输出


Details

详情----------Details----------

In the Agilent microRNA platforms the features are replicated  at a probe level and normally, a single microRNA is interrogated by either two or four sets of replicated probes. The replication of the probes allows  computing the coefficient of variation (CV) for each array as a measure of  the reproducibility of the array. The CV is computed for every set of  replicated probes and the CV median is reported as the array CV. A lower array CV  indicates a better array reproducibility.
在Agilent microRNA的平台的功能将被复制在探针水平，通常是由两个或四个探针集复制的审问，一个单一的microRNA。探针复制允许每个数组作为衡量一个数组的重复性的变异系数（CV）的计算。 CV的计算每复制探针的简历中位数作为数组CV报道。一个较低的阵列的简历表示阵列重复性更好。


值----------Value----------

It prints out the results of the replication for the NON CONTROL FEATURES  at a probe and gene level.
它打印出的探针和基因水平的非控制功能复制的结果。


作者（S）----------Author(s)----------


Pedro Lopez-Romero



举例----------Examples----------


## Not run: [＃无法运行：]
data(dd.micro)
data(targets.micro)

cvArray(dd.micro,"MeanSignal",targets.micro,verbose=TRUE)

graphics.off()

## End(Not run)[＃结束（不运行）]

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。