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R语言 Agi4x44PreProcess包 write.eset()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-25 11:37:07 | 显示全部楼层 |阅读模式
write.eset(Agi4x44PreProcess)
write.eset()所属R语言包:Agi4x44PreProcess

                                         Writes the expression data matrix of an ExpressionSet object in a file
                                         在一个文件中写入一个ExpressionSet对象的表达数据矩阵

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Writes the expression data matrix of an ExpressionSet object in a file.
写入表达数据矩阵的在文件ExpressionSet对象。


用法----------Usage----------


write.eset(eset, ddPROC, annotation.package, targets)



参数----------Arguments----------

参数:eset
An Expression object, normally containing the procesed data
Expression对象,通常包含procesed的数据


参数:ddPROC
An RGList object, normally containing the processed data   
一个RGList对象,处理的数据通常包含


参数:annotation.package
a character specifying the AGI annotation package: 'hgug4112a.db','mgug4122a.db'   
一个字符指定的AGI注解包:“hgug4112a.db,mgug4122a.db”


参数:targets
data.frame with the targets structure  
数据框与目标结构


Details

详情----------Details----------

Writes the expression data matrix of an ExpressionSet object in a file. It also writes out the mappings of the Agilent PROBE ID with the ACCNUM, SYMBOL, ENTREZID and DESCRIPTION fields, using the corresponding annotation package
写入表达数据矩阵的在文件ExpressionSet对象。它还写出了安捷伦探针ID的映射与的ACCNUM,符号,ENTREZID和描述字段,使用相应的注解包


作者(S)----------Author(s)----------


Pedro Lopez-Romero



参见----------See Also----------

build.eset  
build.eset


举例----------Examples----------


## Not run: [#无法运行:]
        data(dd)
        data(targets)
        library(hgug4112a.db)
        selSNR=which(dd$genes$ControlType==0)
        dd.aux=dd[selSNR,]
        index=which(duplicated(dd.aux$genes$ProbeName)==FALSE)
        dd.aux=dd.aux[index,]
        eset.test=build.eset(dd.aux,targets,makePLOT=TRUE,
                annotation.package="hgug4112a.db")
       
        write.eset(eset.test,dd.aux,"hgug4112a.db",targets)


## End(Not run)[#结束(不运行)]

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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