R语言 Agi4x44PreProcess包 summarize.probe()函数中文帮助文档(中英文对照)

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summarize.probe(Agi4x44PreProcess)
summarize.probe()所属R语言包：Agi4x44PreProcess

                                         Replicated Probes Summarization
                                         复制探针综述

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Computes Median of Replicated non-control probes
计算复制的非控制探针的中位数


用法----------Usage----------


summarize.probe(ddFILT, makePLOT, targets)



参数----------Arguments----------

参数：ddFILT
RGlist, usually containing Normalized and Filtered data  
RGlist，通常包含标准化和过滤数据


参数：makePLOT
LOGICAL: If True it makes graphs  
逻辑：如果为True，使图


参数：targets
data.frame with the target structure  
数据框与目标结构


Details

详情----------Details----------

Normally, the Agilent 4 x 44 chips contain a set of non-control probes that are replicated up to ten times. These probes are spread over the chip and allow measuring the chip reproducibility in terms of the coefficient of variation ( of the array. A lower CV median indicates a better reproducibility of the array. It uses an RGList as an input and it produces another RGList where each set of replicated non-control probes have been collapsed into a single value computed as the median of the probes intensities belonging to the same set.   Normally, the input RGList is the 'filtered data', but other RGList can be used as inputs.   This is an optional step.        
通常情况下，安捷伦的4×44芯片中包含了一套非控制探针被复制到十倍。这些探针分布在芯片，使测量重复性的变异系数（阵列芯片方面。一个较低的简历中位数表示数组的一个更好的可重复性。它使用RGList作为输入，并产生另一个RGList每一套复制的非控制探针已倒塌成的探针强度属于同一组的中位数计算单个值。通常情况下，的输入RGList是“过滤数据”，但其他RGList可以被用作输入。这是一个可选的步骤。


值----------Value----------

RGList
RGList


作者（S）----------Author(s)----------


Pedro Lopez-Romero



参见----------See Also----------

CV.rep.probes
CV.rep.probes


举例----------Examples----------


## Not run: [＃无法运行：]
        data(targets)       
        data(dd)
        ddPROC=summarize.probe(dd,makePLOT=TRUE,targets)

## End(Not run)[＃结束（不运行）]

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