R语言 Agi4x44PreProcess包 hierclus()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

hierclus(Agi4x44PreProcess)
hierclus()所属R语言包：Agi4x44PreProcess

                                         Hierarchical clustering  
                                         层次聚类

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Hierarchical cluster of samples using the 'hclust' function
聚类使用的“hclust功能的样品


用法----------Usage----------


hierclus(object, GErep, methdis, methclu,sel, size)



参数----------Arguments----------

参数：object
An expression Matrix  
矩阵表达式


参数：GErep
Numerical vector that relates each sample with its experimental condition  
数值向量，涉及每个样品与实验条件


参数：methdis
the distance measure to be used. Options are 'euclidean' and 'pearson'. see 'dist' function   
要使用的距离度量。选项是“欧几里德”和“培”。见“区”的功能


参数：methclu
the agglomeration method to be used by the 'hclust' function   
“hclust”功能的集聚方法


参数：sel
logical, if TRUE selects the 'size' highest variance genes for the plot   
逻辑，如果TRUE选择“大小”的图最高的变异基因


参数：size
selects the 'size' highest variance genes for the plot if 'sel=TRUE'   
选择“大小”最高图的变异基因，如果“SEL = TRUE”


作者（S）----------Author(s)----------


Pedro Lopez-Romero



参见----------See Also----------

hclust,dist
hclust，区


举例----------Examples----------


## Not run: [＃无法运行：]
        data(dd)
        data(targets)
        GErep=targets$GErep
        selSNR=which(dd$genes$ControlType==0)
        dd.aux=dd[selSNR,]
        index=which(duplicated(dd.aux$genes$ProbeName)==FALSE)
        dd.aux=dd.aux[index,]
        hierclus(dd.aux$G,GErep,methdis="euclidean",
        methclu="complete",sel=FALSE,100)

## End(Not run)[＃结束（不运行）]

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。