genes.rpt.agi(Agi4x44PreProcess)
genes.rpt.agi()所属R语言包：Agi4x44PreProcess
Genes interrogated for different probes
针对不同的探针审问的基因
译者：生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Some Genes are interrogated by different probes at different positions. This function identifies different probes interrogating the same gene. This group of probes is called a GENE SET.
一些基因在接受审讯时不同的探针，在不同的位置。此功能标识询问同一基因的不同的探针。这组探针被称为基因组。
用法----------Usage----------
genes.rpt.agi(dd, annotation.package, raw.data, WRITE.html, REPORT)
参数----------Arguments----------
参数：dd
An RGList: raw data or Processed data
一个RGList：原始数据或加工数据
参数：annotation.package
a character specifying the AGI annotation package: 'hgug4112a.db','mgug4122a.db'
一个字符指定的AGI注解包：“hgug4112a.db，mgug4122a.db”
参数：raw.data
logical, if TRUE it uses RAW data, otherwise it uses PROCESSED data
逻辑，如果TRUE使用RAW数据，否则使用处理过的数据
参数：WRITE.html
logical, if TRUE it writes an html output
逻辑，如果TRUE写一个HTML输出
参数：REPORT
logical, if TRUEit generates an information REPORT
逻辑，如果TRUE它会生成一个信息报告
值----------Value----------
Generates an 'html' file and a 'txt' file with information about genes that are interrogated for different probes at different chr positions. The 'html' file includes a link to the ENSEMBL data base, exactly to the chr region where the 60 base agilent probe claims to be located. Chr coordinates are taken directly from the agilent files (data files obtained after image scanning and using Agilent Feature Extraction)
生成一个“HTML”文件和“TXT”文件不同的探针审问基因在不同的字符的位置信息。 “HTML”的文件，包括链接到的ENSEMBL数据的基础上，指完全CHR区域，其中60碱基安捷伦探针声称将位于。 CHR坐标直接从安捷伦的文件（扫描后的图像中获得的数据文件和使用安捷伦特征提取）
作者（S）----------Author(s)----------
Pedro Lopez-Romero
举例----------Examples----------
data(dd)
library(hgug4112a.db)
genes.rpt.agi(dd,"hgug4112a.db",raw.data=TRUE,
WRITE.html=TRUE,REPORT=TRUE)
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发表于 2012-2-25 11:35:11
