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R语言 Agi4x44PreProcess包 filter.PopnOL()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-25 11:34:09 | 显示全部楼层 |阅读模式
filter.PopnOL(Agi4x44PreProcess)
filter.PopnOL()所属R语言包:Agi4x44PreProcess

                                          probes.filter (Internal function)
                                         probes.filter(内部函数)

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

An internal function to be used by filter.probes
一个内部函数filter.probes


用法----------Usage----------


filter.PopnOL(ddFILT, limPopnOL, ManuelaGO, targets, annotation.package)



参数----------Arguments----------

参数:ddFILT
an RGlist object   
RGlist对象


参数:limPopnOL
for a given feature xi accros samples, is the maximum  in a experimental condition with a saturation-FLAG = 1 (Is Pop OL)   
对于一个给定的功能第十一accros样品,在实验条件下饱和标志的最高= 1(这是流行的OL)


参数:ManuelaGO
logical, if a known annotation package is available then it is TRUE   
逻辑,如果一个已知的注解包是可用的,那么它是TRUE


参数:targets
data.frame with the target structure   
数据框与目标结构


参数:annotation.package
a character specifying the AGI annotation package: 'hgug4112a.db','mgug4122a.db'   
一个字符指定的AGI注解包:“hgug4112a.db,mgug4122a.db”


Details

详情----------Details----------

To keep good quality probes, we filtered out probes that had more than y in at least one experimental condition with a flag indicating presence of Population Outlier. A feature is a population outlier if its signal is lower than a lower threshold or higher than an upper threshold determined using a multiplier (1.42) times the interquartile range of the population. 1 indicates Feature is a population outlier.
为了保持良好的品质探针,筛选出探针,至少在一个实验条件与人口离群的一个标志,指示存在小于y。一个特点是人口离群,如果它的信号是阈值较低低于或高于上限阈值确定使用乘数(1.42)倍人口的四分范围。 1表示的特点是人口离群。


值----------Value----------

An RGlist with probes that are not Population Outlier  (according to the correspondind AFE flag and the filtering options). It also writes an output file (IsFeatPopnOL.txt) that contains probes that were filtered out because they were considered Population Outlier.
与人口离群值(根据的correspondind AFE的标志和过滤选项)探针的RGlist。它还写到输出文件(IsFeatPopnOL.txt),其中包含被过滤掉,因为他们被认为是人口离群的探针。


作者(S)----------Author(s)----------


Pedro Lopez-Romero



参见----------See Also----------

filter.probes
filter.probes


举例----------Examples----------


## Not run: [#无法运行:]
        data(dd)
        data(targets)
        library(hgug4112a.db)
        ddFILT=filter.PopnOL(dd,25,TRUE,targets,"hgug4112a.db")
        dim(ddFILT)

## End(Not run)[#结束(不运行)]

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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