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R语言 Agi4x44PreProcess包 build.mappings()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-25 11:33:12 | 显示全部楼层 |阅读模式
build.mappings(Agi4x44PreProcess)
build.mappings()所属R语言包:Agi4x44PreProcess

                                         Creates data.frame with  
                                         创建数据框与

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Data frame with the mappings for the PROBE ID in the corresponding annotation package
探针ID映射为相应的注解包在数据框


用法----------Usage----------


build.mappings(esetPROC, annotation.package)



参数----------Arguments----------

参数:esetPROC
Expression Set object containing processed DATA   
表达式设置处理的数据对象,其中包含


参数:annotation.package
character specifying the AGI annotation package: 'hgug4112a.db','mgug4122a.db'
字符指定的AGI注解包:“hgug4112a.db,mgug4122a.db


Details

详情----------Details----------

Creates a data.frame: by rows it contains PROBE IDs and   by columns contains "ACCNUM","SYMBOL","ENTREZID",  "DESCRIPTION","GO.Id" and "GO.Terms" for each probe. Mappings are extracted from the corresponding annotation package.          Usually this function is applied to an Expression Set object containing the processed data
创建一个数据框:按行,它包含了探针标识列包含“ACCNUM”,“象征”,“ENTREZID”,“说明”,“GO.Id”和“GO.Terms”每个探针。映射提取相应的注解包。此功能一般应用于表达式设置处理的数据对象,其中包含


值----------Value----------

data.frame
数据框


作者(S)----------Author(s)----------


Pedro Lopez-Romero



参见----------See Also----------

build.eset
build.eset


举例----------Examples----------


## Not run: [#无法运行:]
        data(dd)
        data(targets)
        library(hgug4112a.db)
        selSNR=which(dd$genes$ControlType==0)
        dd.aux=dd[selSNR,]
        index=which(duplicated(dd.aux$genes$ProbeName)==FALSE)
        dd.aux=dd.aux[index,]
        eset.test=build.eset(dd.aux,targets,makePLOT=FALSE,
                annotation.package="hgug4112a.db")

        mappings=build.mappings(eset.test,"hgug4112a.db")
        names(mappings)

## End(Not run)[#结束(不运行)]

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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