R语言 Agi4x44PreProcess包 build.eset()函数中文帮助文档(中英文对照)

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build.eset(Agi4x44PreProcess)
build.eset()所属R语言包：Agi4x44PreProcess

                                         ExpressionSet object from a RGList
                                         ExpressionSet对象从RGList

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

It creates an 'ExpressionSet' object from a 'RGList' containing unique ProbeNames  
它创建一个RGList含有独特ProbeNames的一个ExpressionSet对象


用法----------Usage----------


build.eset(RGlist, targets, makePLOT, annotation.package)



参数----------Arguments----------

参数：RGlist
An RGList containing normally the processed data
通常处理的数据包含一个RGList


参数：targets
data.frame with the targets structure  
数据框与目标结构


参数：makePLOT
logical, if TRUE it makes a 'heatmap' with the 100 greater variance genes, a 'hierarchical cluster' with all the genes and a  pca plot
逻辑，如果TRUE它与100更大的变异基因的“热图”，“所有基因的层次聚类和PCA积


参数：annotation.package
a character specifying the AGI annotation package: 'hgug4112a.db','mgug4122a.db'  
一个字符指定的AGI注解包：“hgug4112a.db，mgug4122a.db”


Details

详情----------Details----------

It creates an ExpressionSet object from a RGList.  Usually this function is applied to an RGList object containing the processed data.
它创建了一个从RGList ExpressionSet对象。一般应用于一个RGList处理的数据对象，其中包含此功能。


值----------Value----------

An ExpressionSet object
一个ExpressionSet对象


作者（S）----------Author(s)----------


Pedro Lopez-Romero



参见----------See Also----------

write.eset  
write.eset


举例----------Examples----------


## Not run: [＃无法运行：]
        data(dd)
        data(targets)
        library(hgug4112a.db)
        selSNR=which(dd$genes$ControlType==0)
        dd.aux=dd[selSNR,]
        index=which(duplicated(dd.aux$genes$ProbeName)==FALSE)
        dd.aux=dd.aux[index,]
        eset.test=build.eset(dd.aux,targets,makePLOT=TRUE,
                annotation.package="hgug4112a.db")


## End(Not run)[＃结束（不运行）]

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