R语言 scaRabee包 scarabee.read.model()函数中文帮助文档(中英文对照)

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scarabee.read.model(scaRabee)
scarabee.read.model()所属R语言包：scaRabee

                                         Read scaRabee Model File
                                         读SCARABEE型号文件

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

scarabee.read.model is a secondary function called at each  scaRabee run. It reads and processes the data contained in the specified model file. This function performs numerous checks to ensure that the model  file contains the expected information. scarabee.read.model is  typically not be called directly by users.
scarabee.read.model在每一个scaRabee的run函数调用是次要的。它在指定的模型文件中包含的数据读取和处理。此功能进行多次检查，以确保该模型文件中包含预期的信息。 scarabee.read.model通常不会被直接调用的用户。


用法----------Usage----------


  scarabee.read.model(files = NULL,
                      runtype = NULL)



参数----------Arguments----------

参数：files
A list of input used for the analysis. The following elements are expected and none of them could be null:     
用于分析的输入的列表。预计下列元素和他们没有可能为空：

dataA .csv file located in the working directory, which contains the dosing information, the observations of the dependent variable(s) to be modeled, and possibly covariate information. The expected format  of this file is described in details in vignette('scaRabee', package='scaRabee').  
DATAA。csv文件的工作目录，其中包含的剂量信息，（因变量）的意见进行建模，以及可能的协变量的信息。该文件格式的细节vignette('scaRabee', package='scaRabee')。

paramA .csv file located in the working directory, which contains the initial guess(es) for the model parameter(s) to be optimized or used for model simulation. The expected format of this file is described in details in vignette('scaRabee',package='scaRabee').  
帕拉马。csv文件的工作目录，其中包含了最初的猜测（ES）进行优化或用于模型仿真模型参数（S）。该文件格式的细节vignette('scaRabee',package='scaRabee')。

modelA text file located in the working directory, which defines  the model. Models specified with explicit, ordinary or delay differential equations are expected to respect a certain syntax and  organization detailed in vignette('scaRabee',package='scaRabee').  
MODELA工作目录中的文本文件，它定义了模型。指定明确的，普通或延迟微分方程模型应尊重一定的语法和组织中详述vignette('scaRabee',package='scaRabee')。

iterA .csv file reporting the values of the objective function and estimates of model parameters at each iteration.  (Not used for  simulation runs).  
迭代。csv文件报告在每次迭代的目标函数和模型参数的估计值。 （不用于模拟运行）。

reportA text file reporting for each individual in the dataset the final parameter estimates for structural model parameters, residual  variability and secondary parameters as well as the related statistics  (coefficients of variation, confidence intervals, covariance and  correlation matrix). (Not used for simulation runs).  
reportA文本文件报告为每个数据集的结构模型参数，剩余的可变性和次要参数以及相关的统计数据（系数的变化，置信区间，协方差和相关矩阵）的最后一个参数估计。 （不用于模拟运行）。

predA .csv file reporting the predictions and calculated residuals for each individual in the dataset. (Not used for simulation runs).  
报告的预测和计算残差的每一个人在该数据集的捕食者。csv文件。 （不用于模拟运行）。

estA .csv file reporting the final parameter estimates for each individual in the dataset. (Not used for simulation runs).  
ESTA。csv文件，报告的最后一个参数估计为每个数据集。 （不用于模拟运行）。

simA .csv file reporting the simulated model predictions for each  individual in the dataset. (Not used for estimation runs).     
司马。csv文件报告为每个数据集模拟模型的预测结果。 （不用于估计运行）。


参数：runtype
A single character string, indicating the type of run; either 'estimation', 'simulation', or 'gridsearch'.
一个字符串，表示类型的运行;要么“估计”，“仿真”，或“gridsearch。


值----------Value----------

Return a list with various levels, depending on the content of the model file
与各级返回一个列表，这取决于在内容模型文件




name The character string which follows the $ANALYSIS tag.
名字的字符串，如下分析标签。




template A character string, indicating which scaRabee function needs to be called to evaluate the model. This level is set to 'ode.model' if the $ODE tag is detected, to 'dde.model' if the $DDE tag is detected, and
模板的一个字符串，表明需要评估模型被称为SCARABEE功能。此级别设置ode.model如果$ ODE检测到标签，dde.model如果$ DDE标记检测，并




derived A character string containing the R code provided within the
得出一个字符串，其中包含的R提供的代码在




ic A character string containing the R code provided within the $IC
IC构成一个字符串，包含R代码内提供的$ IC




scale A character string containing the R code provided within the
扩展一个字符串，它包含在R代码




de A character string containing the R code provided within the
去内提供一个字符串，包含R代码




lags A character string containing the R code provided within the
滞后的R提供的代码在一个字符串，其中包含




output A character string containing the R code provided within the
输出一个字符串包含的R代码内提供




var A character string containing the R code provided within the
var目录包含一个字符串内提供的R代码




sec A character string containing the R code provided within the
秒字符的字符串，其中包含的R代码内提供


（作者）----------Author(s)----------



Sebastien Bihorel (<a href="mailto:sb.pmlab@gmail.com">sb.pmlab@gmail.com</a>)




参见----------See Also----------

scarabee.analysis
scarabee.analysis

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注：
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