finalize.report(scaRabee)
finalize.report()所属R语言包：scaRabee
Finalize Estimation Report
最终完成评估报告书
译者：生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
finalize.report is a secondary function called at the end of the estimation runs. It outputs to the report file the final parameter estimates for structural model parameters, residual variability and secondary parameters as well as the related statistics (coefficients of variation, confidence intervals, covariance and correlation matrix). finalize.report is typically not called directly by users.
finalize.report是在结束的估计运行的二次函数调用。它的输出报告文件，最后一个参数的结构模型参数，剩余的可变性和次要参数估计以及相关的统计数据（系数的变化，置信区间，协方差和相关矩阵）。 finalize.report通常不直接调用用户。
用法----------Usage----------
finalize.report(problem = NULL,
Fit = NULL,
files = NULL)
参数----------Arguments----------
参数：problem
A list containing the following levels:
一个列表，其中包含以下几个层次：
dataA list containing as many levels as there are treatment levels for the subject (or population) being evaluated, plus the trts level listing all treatments for this subject (or population), and the id level giving the identification number of the subject (or set to 1 if the analysis was run at the level of the population. Each treatment-specific level is a list containing the following levels:
DATAA列表含有作为多层次的，有被评估为主体的处理水平（或人群），加上trts级以上市对这个问题的所有处理（或人群），而id水平给予被检体的识别号码（或设置为1，如果分析在人口水平运行。每个治疗特定的电平是一个列表，其中包含以下级别：
cov mij x 3 data.frame containing the times of observations of the dependent variables (extracted from the TIME variable), the indicators of the type of dependent variables (extracted from the CMT variable), and the actual dependent variable observations (extracted from the DV variable) for this particular treatment.
覆盖MIJ×3数据框的类型相关的变量（CMT变量提取），而实际的因变量的观测指标（含观测到的因变量（从时间变量中提取）的时代，提取的变量）的DV为这个特定的处理。
covmij x c data.frame containing the times of observations of the dependent variables (extracted from the TIME variable) and all the covariates identified for this particular treatment.
covmij XC数据框包含时间的观察因变量（从时间变量中提取）和所有的协变量确定这个特殊的处理。
bolusbij x 4 data.frame providing the instantaneous inputs for a treatment and individual.
bolusbij×4的数据框提供的治疗和个人的瞬时输入。
infusionfij x (4+c) data.frame providing the zero-order inputs for a treatment and individual.
infusionfij×（4 + c的）数据框提供零阶的输入处理和个人。
trtthe particular treatment identifier.
trtthe特别治疗标识符。
methodA character string, indicating the scale of the analysis. Should be 'population' or 'subject'.
了methodA字符串，表示规模的分析。应该是“人口”或“主题”。
initA data.frame of parameter data with the following columns: 'names', 'type', 'value', 'isfix', 'lb', and 'ub'.
INITA数据框的参数数据有以下几列：名称，类型，价值，isfix，磅，和UB。
debugmodeLogical indicator of debugging mode.
除错模式的debugmodeLogical指标。
modfunModel function.
modfunModel功能。
参数：Fit
A list containing the following elements:
一个列表，其中包含以下元素：
estimationsThe vector of final parameter estimates.
estimationsThe向量的最后一个参数估计。
fvalThe minimal value of the objective function.
fvalThe的目标函数的值最小。
covThe matrix of covariance for the parameter estimates.
covThe的参数协方差矩阵的估计。
orderedestimationsA data.frame with the same structure as problem$init but only containing the sorted estimated estimates. The sorting is performed by order.param.list.
orderedestimationsA数据框具有相同的结构problem$init但仅包含排序条件估计的估计。排序是由order.param.list。
corThe upper triangle of the correlation matrix for the parameter estimates.
corThe的相关矩阵的上三角的参数估计。
cvThe coefficients of variations for the parameter estimates.
cvThe系数为参数估计的变化。
ciThe confidence interval for the parameter estimates.
ciThe的参数的置信区间估计。
AICThe Akaike Information Criterion.
AICThe赤池信息准则。
secA list of data related to the secondary parameters, containing the following elements:
SECA二次参数有关的数据列表，包含以下元素：
estimates The vector of secondary parameter estimates calculated using the initial estimates of the primary model parameters.
估计矢量副参数估计来计算的主要模型参数的初步估计。
estimatesThe vector of secondary parameter estimates calculated using the final estimates of the primary model parameters.
estimatesThe矢量副参数估计来计算的主要模型参数的最终估计。
namesThe vector of names of the secondary parameter estimates.
namesThe向量的二次参数估计的名称。
pderThe matrix of partial derivatives for the secondary parameter estimates.
pderThe矩阵的偏导数为辅助参数估计。
covThe matrix of covariance for the secondary parameter estimates.
covThe协方差矩阵的为副参数估计。
cvThe coefficients of variations for the secondary parameter estimates.
cvThe系数的为副参数估计的变化。
ciThe confidence interval for the secondary parameter estimates.
ciThe副参数估计值的置信区间。
参数：files
A list of input used for the analysis. The following elements are expected and none of them could be null:
用于分析的输入的列表。预计下列元素和他们没有可能为空：
dataA .csv file located in the working directory, which contains the dosing information, the observations of the dependent variable(s) to be modeled, and possibly covariate information. The expected format of this file is described in details in vignette('scaRabee', package='scaRabee').
DATAA。csv文件的工作目录，其中包含的剂量信息，（因变量）的意见进行建模，以及可能的协变量的信息。该文件格式的细节vignette('scaRabee', package='scaRabee')。
paramA .csv file located in the working directory, which contains the initial guess(es) for the model parameter(s) to be optimized or used for model simulation. The expected format of this file is described in details in vignette('scaRabee',package='scaRabee').
帕拉马。csv文件的工作目录，其中包含了最初的猜测（ES）进行优化或用于模型仿真模型参数（S）。该文件格式的细节vignette('scaRabee',package='scaRabee')。
modelA text file located in the working directory, which defines the model. Models specified with explicit, ordinary or delay differential equations are expected to respect a certain syntax and organization detailed in vignette('scaRabee',package='scaRabee').
MODELA工作目录中的文本文件，它定义了模型。指定明确的，普通或延迟微分方程模型应尊重一定的语法和组织中详述vignette('scaRabee',package='scaRabee')。
iterA .csv file reporting the values of the objective function and estimates of model parameters at each iteration.
迭代。csv文件报告在每次迭代的目标函数和模型参数的估计值。
reportA text file reporting for each individual in the dataset the final parameter estimates for structural model parameters, residual variability and secondary parameters as well as the related statistics (coefficients of variation, confidence intervals, covariance and correlation matrix).
reportA文本文件报告为每个数据集的结构模型参数，剩余的可变性和次要参数以及相关的统计数据（系数的变化，置信区间，协方差和相关矩阵）的最后一个参数估计。
predA .csv file reporting the predictions and calculated residuals for each individual in the dataset.
报告的预测和计算残差的每一个人在该数据集的捕食者。csv文件。
estA .csv file reporting the final parameter estimates for each individual in the dataset.
ESTA。csv文件，报告的最后一个参数估计为每个数据集。
simA .csv file reporting the simulated model predictions for each individual in the dataset. (Not used for estimation runs).
司马。csv文件报告为每个数据集模拟模型的预测结果。 （不用于估计运行）。
值----------Value----------
Return a modified version of Fit, containing the following elements:
返回一个修改后的版本的Fit，包含以下元素：
estimations The vector of final parameter estimates.
估计最终的参数估计值的矢量。
fval The minimal value of the objective function.
未来值的目标函数的极小值。
cov The matrix of covariance for the parameter estimates.
覆盖的协方差矩阵的参数估计。
orderedestimations A data.frame with the same structure as problem$init but only containing the sorted estimated estimates.
orderedestimations数据框相同的结构problem$init“，但只有包含的排序估计估计。
cor The upper triangle of the correlation matrix for the parameter
心病的参数的相关矩阵的上三角
cv The coefficients of variations for the parameter estimates.
CV系数为参数估计的变化。
ci The confidence interval for the parameter estimates.
CI参数估计值的置信区间。
AIC The Akaike Information Criterion.
赤池信息准则AIC的。
sec A list of data related to the secondary parameters, containing
秒A二次参数有关的数据列表，其中载
estimates A vector of secondary parameter estimates.
估计矢量副参数估计。
cov The matrix of covariance for the secondary parameter
覆盖的协方差矩阵的二次参数
cv The coefficients of variations for the secondary parameter
CV的系数为第二个参数的变化
ci The confidence interval for the secondary parameter
CI副参数的置信区间
orderedfixed A data.frame with the same structure as problem$init but only containing the sorted fixed estimates.
orderedfixed数据框作为problem$init具有相同的结构，但只包含分类固定的估计。
orderedinitial A data.frame with the same content as
orderedinitial数据框相同的内容
（作者）----------Author(s)----------
Sebastien Bihorel (<a href="mailto:sb.pmlab@gmail.com">sb.pmlab@gmail.com</a>)
参见----------See Also----------
order.parms.list,
order.parms.list，
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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。
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发表于 2012-9-29 22:45:20
