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R语言 scaRabee包 finalize.grid.report()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-9-29 22:45:14 | 显示全部楼层 |阅读模式
finalize.grid.report(scaRabee)
finalize.grid.report()所属R语言包:scaRabee

                                         Finalize Direct Grid Search Report
                                         最终确定直接网格搜索报告

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

finalize.grid.report is a secondary function called at the end of the  direct grid search step of the direct grid search runs (this step is actually by a simulation step). It outputs to the report file the grid search summary  table produced by scarabee.gridsearch. finalize.grid.report is  typically not called directly by users.
finalize.grid.report是一个二次函数调用结束时直接电网的搜索运行(这一步实际上是由一个模拟步骤)直接网格搜索步骤。它的输出报告文件的网格搜索产生的scarabee.gridsearch汇总表。 finalize.grid.report通常不直接调用用户。


用法----------Usage----------


  finalize.grid.report(problem = NULL,
                      fgrid = NULL,
                      files = NULL)



参数----------Arguments----------

参数:problem
A list containing the following levels:   
一个列表,其中包含以下几个层次:

dataA list which content depends on the scope of the analysis. If  the analysis was run at the level of the subject, data contains as  many levels as the number of subjects in the dataset, plus the ids level containing the vector of identification numbers of all subjects  included in the analysis population. If the analysis was run at the level  of the population, data contains only one level of data and  ids is set to 1.  Each subject-specific level contains as many levels as there are treatment levels for this subject, plus the trts level listing all treatments for this subject, and the id level giving the identification number of the subject.   Each treatment-specific levels is a list containing the following levels:      
DATAA列表的内容取决于分析的范围。如果分析被运行在被检体的水平,data中的数据集的数量的受试者包含尽可能多的水平,加上ids水平含有向量的所有主题的识别号码包含在分析人口。如果分析在人口水平运行,data只包含一个电平的数据和ids被设置为1。每个特定主题的多层次,有对这个问题的处理水平,加上trts级以上市对这个问题的所有治疗,和id水平的标识号的主题。每一个具体的治疗水平是一个列表,其中包含以下几个层次:

cov mij x 3 data.frame containing the times of observations of the dependent variables (extracted from the TIME variable), the indicators of the type of dependent variables (extracted from the CMT variable), and the actual dependent variable observations (extracted from the  DV variable) for this particular treatment and this particular  subject.  
覆盖MIJ×3数据框的类型相关的变量(CMT变量提取),而实际的因变量的观测指标(含观测到的因变量(从时间变量中提取)的时代,提取的DV变量)这个特殊的处理,这特定主题。

covmij x c data.frame containing the times of observations of  the dependent variables (extracted from the TIME variable) and all the covariates identified for this particular treatment and this  particular subject.   
covmij XC数据框包含因变量(从时间变量中提取)和这个特殊的治疗和这个特定的主题确定为所有的协变量的观测时间。

bolusbij x 4 data.frame providing the instantaneous inputs  for a treatment and individual.  
bolusbij×4的数据框提供的治疗和个人的瞬时输入。

infusionfij x (4+c) data.frame providing the zero-order inputs for a treatment and individual.  
infusionfij×(4 + c的)数据框提供零阶的输入处理和个人。

trtthe particular treatment identifier.      
trtthe特别治疗标识符。

methodA character string, indicating the scale of the analysis. Should be 'population' or 'subject'.  
了methodA字符串,表示规模的分析。应该是“人口”或“主题”。

initA data.frame of parameter data with the following columns: 'names', 'type', 'value', 'isfix', 'lb', and 'ub'.  
INITA数据框的参数数据有以下几列:名称,类型,价值,isfix,磅,和UB。

debugmodeLogical indicator of debugging mode.  
除错模式的debugmodeLogical指标。

modfunModel function.     
modfunModel功能。


参数:fgrid
A data.frame with pe+2 columns. The last 2 columns report the value and the feasibility of the objective function at each specific vector of  parameter estimates which is documented in the first pe columns. This  data.frame must be ordered by feasibility and increasing value of the objective function.
数据框PE +2列。最后2列报告的目标函数在每一个具体的PE在第一列向量参数估计值的记录的价值和可行性。数据框必须订购的可行性和增加值的目标函数。


参数:files
A list of input used for the analysis. The following elements are expected and none of them could be null:     
用于分析的输入的列表。预计下列元素和他们没有可能为空:

dataA .csv file located in the working directory, which contains the dosing information, the observations of the dependent variable(s) to be modeled, and possibly covariate information. The expected format  of this file is described in details in vignette('scaRabee', package='scaRabee').  
DATAA。csv文件的工作目录,其中包含的剂量信息,(因变量)的意见进行建模,以及可能的协变量的信息。该文件格式的细节vignette('scaRabee', package='scaRabee')。

paramA .csv file located in the working directory, which contains the initial guess(es) for the model parameter(s) to be optimized or used for model simulation. The expected format of this file is described in details in vignette('scaRabee',package='scaRabee').  
帕拉马。csv文件的工作目录,其中包含了最初的猜测(ES)进行优化或用于模型仿真模型参数(S)。该文件格式的细节vignette('scaRabee',package='scaRabee')。

modelA text file located in the working directory, which defines  the model. Models specified with explicit, ordinary or delay  differential equations are expected to respect a certain syntax and  organization detailed in vignette('scaRabee',package='scaRabee').  
MODELA工作目录中的文本文件,它定义了模型。指定明确的,普通或延迟微分方程模型应尊重一定的语法和组织中详述vignette('scaRabee',package='scaRabee')。

iterA .csv file reporting the values of the objective function and estimates of model parameters at each iteration. (Not used for direct grid search runs).  
迭代。csv文件报告在每次迭代的目标函数和模型参数的估计值。 (不用于直接电网运行搜索的)。

reportA text file reporting the summary tables of ordered  objective function values for the various tested vectors of model  parameters.  
reportA文本文件,报告的汇总表有序的目标函数值的各种模型参数的测试向量。

predA .csv file reporting the predictions and calculated residuals for each individual in the dataset. (Not used for direct grid search  runs).  
报告的预测和计算残差的每一个人在该数据集的捕食者。csv文件。 (不用于直接电网运行搜索的)。

estA .csv file reporting the final parameter estimates for each individual in the dataset. (Not used for direct grid search runs).  
ESTA。csv文件,报告的最后一个参数估计为每个数据集。 (不用于直接电网运行搜索的)。

simA .csv file reporting the simulated model predictions for each  individual in the dataset. (Not used for direct grid search runs).     
司马。csv文件报告为每个数据集模拟模型的预测结果。 (不用于直接电网运行搜索的)。


值----------Value----------

Does not return any value.
不返回任何值。


(作者)----------Author(s)----------



Sebastien Bihorel (<a href="mailto:sb.pmlab@gmail.com">sb.pmlab@gmail.com</a>)




参见----------See Also----------

scarabee.gridsearch,
scarabee.gridsearch,

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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