R语言 affy包 read.probematrix()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

read.probematrix(affy)
read.probematrix()所属R语言包：affy

                                        Read CEL file data into PM or MM matrices
                                         CEL的文件数据读入到下午或MM矩阵

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Read CEL data into matrices.
CEL的数据读入矩阵。


用法----------Usage----------


read.probematrix(..., filenames = character(0),
                 phenoData = new("AnnotatedDataFrame"),
                 description = NULL,
                 notes = "",
                 compress = getOption("BioC")$affy$compress.cel,
                 rm.mask = FALSE, rm.outliers = FALSE, rm.extra = FALSE,
                 verbose = FALSE, which = "pm", cdfname = NULL)



参数----------Arguments----------

参数：...
file names separated by comma.
用逗号分隔的文件名。


参数：filenames
file names in a character vector.
文件名称中的字符向量。


参数：phenoData
a AnnotatedDataFrame object.
AnnotatedDataFrame对象。


参数：description
a MIAME object.
MIAME对象。


参数：notes
notes.
笔记。


参数：compress
are the CEL files compressed?
CEL文件压缩？


参数：rm.mask
should the spots marked as 'MASKS' set to NA?
斑点标示为“面具”设置为NA？


参数：rm.outliers
should the spots marked as 'OUTLIERS' set to NA?
斑点标示为“离群”设置NA？


参数：rm.extra
if TRUE, overrides what is in rm.mask and rm.oultiers.
如果TRUE，覆盖rm.mask和rm.oultiers是什么。


参数：verbose
verbosity flag.
冗长的标志。


参数：which
should be either "pm", "mm" or "both".
应该不是“分”，“MM”或“both”。


参数：cdfname
Used to specify the name of an alternative cdf package. If set to NULL, the usual cdf package based on Affymetrix's mappings will be used.
用于指定替代的CDF包的名称。如果设置为NULL，通常CDF包基于Affymetrix公司的映射将被使用。


值----------Value----------

A list of one or two matrices. Each matrix is either PM or MM data. No AffyBatch is created.
一个或两个矩阵列表。每个矩阵可以是下午或MM的数据。没有AffyBatch创建。


作者（S）----------Author(s)----------


Ben Bolstad <a href="mailto:bmb@bmbolstad.com">bmb@bmbolstad.com</a>



参见----------See Also----------

AffyBatch,
AffyBatch

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注：
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