R语言 affy包 mas5()函数中文帮助文档(中英文对照)

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mas5(affy)
mas5()所属R语言包：affy

                                        MAS 5.0 expression measure
                                         MAS 5.0表达式措施

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function converts an instance of AffyBatch into an instance of ExpressionSet using our implementation of Affymetrix's MAS 5.0 expression measure.
这个函数转换成实例AffyBatch到ExpressionSet使用Affymetrix公司的MAS实现5.0表达措施的一个实例。


用法----------Usage----------


mas5(object, normalize = TRUE, sc = 500, analysis = "absolute", ...)



参数----------Arguments----------

参数：object
an instance of AffyBatch
一个AffyBatch的实例


参数：normalize
logical. If TRUE scale normalization is used after we obtain an instance of ExpressionSet
逻辑。如果TRUE规模标准化后，我们得到ExpressionSet例如


参数：sc
Value at which all arrays will be scaled to.
值在所有阵列将被缩小。


参数：analysis
should we do absolute or comparison analysis, although "comparison" is still not implemented.
我们应该做的绝对或比较分析，虽然仍然没有实现“比较”。


参数：...
other arguments to be passed to expresso.
其他参数被传递到expresso。


Details

详情----------Details----------

This function is a wrapper for expresso and
此功能是为expresso的包装和


值----------Value----------

ExpressionSet
ExpressionSet

The methods used by this function were implemented based upon available documentation. In particular a useful reference is Statistical Algorithms Description Document by Affymetrix. Our implementation is based on what is written in the documentation and, as you might appreciate, there are places where the documentation is less than clear. This function does not give exactly the same results. All source code of our implementation is available. You are free to read it and suggest fixes.
此功能所使用的方法，实施根据现有的文件。特别是一个有用的参考是由Affymetrix公司的统计算法描述文件。我们的实现是基于书面文档，你可以欣赏，也有地方的文件明确。此功能不完全相同的结果。我们执行的所有的源代码是可用的。你可以自由阅读，并提出修正建议。

For more information visit this URL: http://stat-www.berkeley.edu/users/bolstad/
欲了解更多信息，请访问这个网址：http://stat-www.berkeley.edu/users/bolstad/


参见----------See Also----------

expresso,affy.scalevalue.exprSet
expresso，affy.scalevalue.exprSet


举例----------Examples----------


if (require(affydata)) {
  data(Dilution)
  eset <- mas5(Dilution)
}

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。