R语言 affy包 MAplot()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

MAplot(affy)
MAplot()所属R语言包：affy

                                        Relative M vs. A plots
                                         与一个图的相对中号

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Create boxplots of M or M vs A plots. Where M is determined relative to a specified chip or to a pseudo-median reference chip.
创建M或m与一个图的盒状图。其中M是相对确定到指定的芯片或伪中位数参考芯片。


用法----------Usage----------


MAplot(object,...)
Mbox(object,...)
ma.plot(A, M, subset = sample(1:length(M), min(c(10000, length(M)))),
        show.statistics = TRUE, span = 2/3, family.loess = "gaussian",
        cex = 2, plot.method = c("normal","smoothScatter","add"),
        add.loess = TRUE, lwd = 1, lty = 1, loess.col = "red", ...)



参数----------Arguments----------

参数：object
an AffyBatch-class.
AffyBatch-class。


参数：...
additional parameters for the routine.
常规的额外参数。


参数：A
a vector to plot along the horizontal axis.
沿水平轴的矢量绘制。


参数：M
a vector to plot along vertical axis.
沿垂直轴绘制一个矢量。


参数：subset
a set of indices to use when drawing the loess curve.
黄土曲线绘制时使用的一套指数。


参数：show.statistics
logical. If TRUE, some summary statistics of the M values are drawn.
逻辑。如果是TRUE，M值的一些汇总统计得出的。


参数：span
span to be used for loess fit.
跨度黄土适合使用。


参数：family.loess
"guassian" or "symmetric" as in loess.
"guassian"或"symmetric"loess。


参数：cex
size of text when writing summary statistics on plot.
积汇总统计时写的文字大小。


参数：plot.method
a string specifying how the plot is to be drawn. "normal" plots points, "smoothScatter" uses the smoothScatter function. Specifying "add" means that the MAplot should be added to the current plot.
一个字符串，指定要绘制的图是如何。 "normal"图点，"smoothScatter"使用smoothScatter功能。指定"add"意味着，的MAplot应该被添加到当前的图。


参数：add.loess
add a loess line to the plot.
添加黄土线的图。


参数：lwd
width of loess line.
黄土线的宽度。


参数：lty
line type for loess line.
黄土线的线路类型。


参数：loess.col
color for loess line.
黄土线的颜色。


参见----------See Also----------

mva.pairs
mva.pairs


举例----------Examples----------


if (require(affydata)) {
   data(Dilution)
   MAplot(Dilution)
   Mbox(Dilution)
}

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