ics.act(SamplerCompare)
ics.act()所属R语言包:SamplerCompare
Compute the autocorrelation time of a chain
计算自相关的时间的一个链
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Computes the autocorrelation time of an MCMC chain
计算自相关时间的MCMC链
用法----------Usage----------
ics.act(X, true.mean=colMeans(as.matrix(X)))
参数----------Arguments----------
参数:X
A matrix or vector containing the states of a stationary Markov chain. Each row is a single state.
包含一个静止的状态的马尔可夫链甲矩阵或矢量。每一行是一个单一的国家。
参数:true.mean
A vector containing the true mean of X. It should have as many elements as X has columns. The default is to use the sample mean; this can lead the procedure to underestimate the ACT if the simulation has not converged.
一个向量,包含真正的平均X。它应该有尽可能多的元素X列。默认情况下使用的样本均值,这可能会导致低估了ACT的程序,如果模拟没有收敛,。
Details
详细信息----------Details----------
ics.act computes the autocorrelation time of chain represented by X using the initial convex sequence (Geyer 1992). It is roughly equivalent to the maximum of initseq(xx)$var.con / initseq(xx)$gamma0 where xx ranges over the columns of X, but properly handles the case where the true mean of the target distribution is known.
ics.act计算的自相关时间链为代表的X使用初始的凸序列(盖尔1992年)。这是大致相当于最大initseq(xx)$var.con / initseq(xx)$gamma0xx范围在列X,但妥善处理的情况下,真正的平均目标分布是已知的。
Callers may want to remove a burn-in period from a sample before passing it to ics.act.
市民可以从样品前将它传递给ics.act要删除一个老化期。
This is not intended for regular use; it is included as a way to cross-check the results of ar.act. It depends on the mcmc package.
这并不是经常使用,它是作为一种交叉检查的结果ar.act。取决于mcmc包。
值----------Value----------
The estimated autocorrelation time of X.
估计自相关时间X。
注意----------Note----------
This function bypasses the interface of mcmc, and may break if the implementation of initseq changes.
此功能绕过接口的mcmc,并可能打破如果执行initseq变化的。
参考文献----------References----------
Statistical Science 7(4):473-511.
参见----------See Also----------
ar.act, mcmc::initseq
ar.act,mcmc::initseq
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