R语言 s4vd包 stabpath()函数中文帮助文档(中英文对照)

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stabpath(s4vd)
stabpath()所属R语言包：s4vd

                                         Stability paths plot
                                         稳定路径图

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

The function plots the stability path of a S4VD result
函数曲线的稳定性路径的S4VD结果


用法----------Usage----------


stabpath(res,number)



参数----------Arguments----------

参数：res
the S4VD result   
S4VD结果


参数：number
the bicluster for which the stability path shall be plotted
的稳定性路径应绘制的bicluster


Details

详细信息----------Details----------

Plots the stability path for the rows and the columns regarding the last iteration of the s4vd algorithm. Note that if the pointwise error control was used or if savepath=FALSE the final selection probabilities for the rows and the columns will be plotted.  
图解关于最后一次迭代的s4vd算法的行和列的稳定路径。请注意，如果使用或逐点误差控制savepath = FALSE最终选择的行和列的概率将被绘制。


（作者）----------Author(s)----------



Martin Sill \
<a href="mailto:m.sill@dkfz.de">m.sill@dkfz.de</a>




实例----------Examples----------


# example data set according to the simulation study in Lee et al. 2010[例如数据集，根据Lee等人的模拟研究。 2010]
# generate artifical data set and a correspondig biclust object[产生人工数据集和correspondig的biclust对象]
u <- c(10,9,8,7,6,5,4,3,rep(2,17),rep(0,75))
v <- c(10,-10,8,-8,5,-5,rep(3,5),rep(-3,5),rep(0,34))
u <- u/sqrt(sum(u^2))
v <- v/sqrt(sum(v^2))
d <- 50
set.seed(1)
X <- (d*u%*%t(v)) + matrix(rnorm(100*50),100,50)
params <- info <- list()
RowxNumber <- matrix(rep(FALSE,100),ncol=1)
NumberxCol <- matrix(rep(FALSE,50),nrow=1)
RowxNumber[u!=0,1] <- TRUE
NumberxCol[1,v!=0] <- TRUE
Number <- 1
ressim <- BiclustResult(params,RowxNumber,NumberxCol,Number,info)
#perform s4vd biclustering [执行s4vd双分群]
system.time( ress4vd <- biclust(X,method=BCs4vd,pcerv=0.5,pceru=0.5,ss.thr=c(0.6,0.65),steps=500,pointwise=FALSE,nbiclust=1,savepath=TRUE))
#perform s4vd biclustering with fast pointwise stability selection[执行s4vd双分群选择快速逐点稳定]
system.time( ress4vdpw <- biclust(X,method=BCs4vd,pcerv=0.5,pceru=0.5,ss.thr=c(0.6,0.65),steps=500,pointwise=TRUE,nbiclust=1))
#stability paths[稳定路径]
stabpath(ress4vd,1)
#selection probabilitys for the pointwise stability selection[选择probabilitys稳定的逐点选择]
stabpath(ress4vdpw,1)

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注：
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