R语言 affypdnn包 hgu133a.pdnn.params()函数中文帮助文档(中英文对照)

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hgu133a.pdnn.params(affypdnn)
hgu133a.pdnn.params()所属R语言包：affypdnn

                                        Chip-type specific data
                                         芯片特定的数据类型

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Chip-type specific data structure.
片式结构的具体数据。


用法----------Usage----------



data(hgu95av2.pdnn.params)



格式----------Format----------

The format is a list:
格式是一个列表：




Eg environment (one entry per dinucleotide)
例如环境（每一个核苷酸进入）




Wg numerical vector.
WG数值向量。




En environment (one entry per dinucleotide)
恩环境（每一个核苷酸进入）




Wn numerical vector.
WN数值向量。




gene.Sn list (one entry per affyID)
gene.Sn列表（一每affyID项）




gene.Sg list (one entry per affyID)
gene.Sg列表（一每affyID项）




gene.xy list (one entry per affyID)
gene.xy列表（一每affyID项）




params.gene environment
params.gene环境


Details

详情----------Details----------

These chip-specific data structures are generated from the data files made available by the author of the PDNN paper (see the section source). They are stored as data to save some computation time. The data structures were made using the function pdnn.params.chiptype. The data files are included in the the directory "data" of the package.
这些芯片特定的数据结构生成的PDNN论文的作者（见节源）的数据文件。它们存储data保存一些计算时间。数据结构，使用功能pdnn.params.chiptype。列入目录数据包的数据文件。


注意----------Note----------

To lower the size of the package, the only chip-specific data structures included in the package is the one for HG-U95Av2.
为了降低包的大小，只有芯片特定的数据包中包含的结构是HG-U95Av2之一。


源----------Source----------

Li Zhang, Michael F. Miles and Kenneth D. Aldape - A model of molecular interactions on short oligonucleotide arrays, 2003, Nature Biotech., vol. 21, n.7
张黎，迈克尔·F·迈尔斯和午四Aldape  - 短寡核苷酸阵列的分子间的相互作用模型，2003年，自然生物技术，第一卷。 21，N.7


举例----------Examples----------


## give the path the original energy parameter files included in the package[＃给文件包中包含的原始能量参数的路径]
list.files(system.file("exampleData", package="affypdnn"),
           "^pdnn-energy-parameter_", full.names=TRUE)

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注：
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