R语言 affyPara包 readAffybatchPara()函数中文帮助文档(中英文对照)

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readAffybatchPara(affyPara)
readAffybatchPara()所属R语言包：affyPara

                                        Parallelized Read-AffyBatch function
                                         并行读AffyBatch的功能

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Parallelization of the read.affybatch function. This parallel implementation is especially  useful for multicore machines.
并行的read.affybatch功能。这种并行执行是特别有用的多核机器。


用法----------Usage----------


read.affybatchPara(object,
                phenoData = new("AnnotatedDataFrame"),
                description = NULL, notes = "",       
                cluster, verbose=getOption("verbose"))



参数----------Arguments----------

参数：object
An object of a character vector with the names of CEL files  OR a (partitioned) list of character vectors with CEL file names.
对象characterCEL文件的名称或一个characterCEL文件名向量（分区）列表向量。


参数：phenoData
An AnnotatedDataFrame object.  
AnnotatedDataFrame对象。


参数：description
a 'MIAME' object.
“MIAME对象。


参数：notes
notes.
笔记。


参数：cluster
A cluster object obtained from the function makeCluster in the SNOW package.  For default .affyParaInternalEnv$cl  will be used.  
在雪包的功能makeCluster获得聚类对象。 默认.affyParaInternalEnv$cl将使用。


参数：verbose
A logical value. If TRUE it writes out some messages. default: getOption("verbose")   
一个逻辑值。如果TRUE写了一些消息。默认：getOption（“冗长”）


Details

详情----------Details----------

Parallelized creation of an AffyBatch object. Especially useful on multi-core machines  to accelerate the creation of the AffyBatch object.
并行创建一个AffyBatch对象。特别有用的多核心的机器，加快了创建的AffyBatch对象。

For the serial function and more details see the function read.affybatch.
对于串行功能和更多的细节，请参阅功能read.affybatch。

For using this function a computer cluster using the SNOW package has to be started.  Starting the cluster with the command makeCluster generates an cluster object in the affyPara environment (.affyParaInternalEnv) and  no cluster object in the global environment. The cluster object in the affyPara environment will be used as default cluster object,  therefore no more cluster object handling is required.   The makeXXXcluster functions from the package SNOW can be used to create an cluster object in the global environment and  to use it for the preprocessing functions.
要开始使用此功能的计算机聚类使用雪包。启动命令makeCluster聚类产生的affyPara环境（。affyParaInternalEnv）的，并没有在全球环境中的聚类对象的聚类对象。默认聚类对象将被用作聚类对象在affyPara环境，因此没有更多的聚类对象的处理需要。 makeXXXcluster从包雪功能，可用于创建一个在全球环境中的聚类对象和使用它的预处理功能。


值----------Value----------

An AffyBatch object.
一个AffyBatch对象。


作者（S）----------Author(s)----------


Markus Schmidberger <a href="mailto:schmidb@ibe.med.uni-muenchen.de">schmidb@ibe.med.uni-muenchen.de</a>, Ulrich Mansmann <a href="mailto:mansmann@ibe.med.uni-muenchen.de">mansmann@ibe.med.uni-muenchen.de</a>



举例----------Examples----------


## Not run: [＃无法运行：]
library(affyPara)
if (require(affydata)) {
        celpath <- system.file("celfiles", package="affydata")
    fns <- list.celfiles(path=celpath,full.names=TRUE)

        makeCluster(3)
       
        ##read a text celfile[＃读取文本celfile]
           abatch <- read.affybatchPara(fns[2], verbose=TRUE)
       
        stopCluster()
}

## End(Not run)[＃结束（不运行）]

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