SPLS(RVtests)
SPLS()所属R语言包：RVtests
Sparse PLS for RV Tests
稀疏PLS RV测试
译者：生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Use SPLS for selecting significant variants and testing the variants associated with disease traits.
使用SPLS显着的变种和变异与疾病特征测试。
用法----------Usage----------
SPLS(x, y, scale = TRUE, ncomp, eta.grid, size.max, a = 2, npermutation = 0, npermutation.max, min.nonsignificant.counts)
参数----------Arguments----------
参数：x
Genotype matrix
基因型矩阵
参数：y
Phenotype vector
表型矢量
参数：scale
see spls
看到SPLS
参数：ncomp
Number of components
成分数目
参数：eta.grid
see spls
看到SPLS
参数：size.max
Maximum number of variants included
的最大数量的变种
参数：a
Penalty parameter for information criterion, a=2 for AIC.
惩罚参数的信息准则AIC，A = 2。
参数：npermutation
Number of permutation, if less than 1, the permutation will not be run.
编号的置换，如果小于1，置换不会运行。
参数：npermutation.max
Maximum permutation, if missing, equal to npermutation.
最大排列，如果缺失，等于向npermutation。
参数：min.nonsignificant.counts
Minimum nonsignificant counts, if missing, equal to 10.
最小无显着性计数，如果缺失，等于10。
Details
详细信息----------Details----------
Use spls package to implement SPLS and an information criterion, AIC, BIC, or GIC, to select the best subset of variants.
使用的SPL包来实现SPLS和信息标准，AIC，BIC，或GIC，选择最佳变量子集。
值----------Value----------
参数：nonsignificant.counts
Counts of permuted data that have a higher score than unpermuted data.
排列的数据的有较高的分数比unpermuted数据的计数。
参数：pvalue.empirical
Empirical pvalue via permutation
通过排列的实证P值
参数：pvalue.nominal
Theoretical pvalue for the selected variants
所选变种理论P值
参数：vs
The selected variants
选取的变异
参数：total.permutation
Total permutation
总排列
（作者）----------Author(s)----------
C. Xu
参考文献----------References----------
参见----------See Also----------
spls, LASSO
spls, LASSO
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注：
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注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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发表于 2012-9-29 00:04:19
