R语言 rtfbs包 read.pwm()函数中文帮助文档(中英文对照)

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read.pwm(rtfbs)
read.pwm()所属R语言包：rtfbs

                                        Read PWM object
                                         PWM对象

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Read and log transform Position Weight Matrices (PWMs) from file. Each position weight matrix represents a Transcription Factor motif that is being searched for. Files may contain one or more motifs. Only MEME Text formated files are supported. Look in the examples below to find an example PWM file.
读取并记录变换位置权重矩阵器（PWM）文件。每个位置权重矩阵是一个转录因子正在搜索的主题。文件可能包含一个或多个图案。只有MEME文本格式文件的支持。看看下面的例子中，PWM文件中找到一个例子。


用法----------Usage----------


  read.pwm(filename)



参数----------Arguments----------

参数：filename
Full Path to file of MEME Text format
MEME文本格式文件的完整路径


值----------Value----------

Matrix object containing the Position Weight Matrix read from the file. If the file contains more than one PWM, a list of Matrix objects are returned, one for each PWM. The returned PWMs are log transformed, so that entry [i,j] of the matrix represents the log probability of observing the base from column j in the i'th position of a transcription factor binding site.
Matrix对象，包含从文件中读取的位置权重矩阵。如果文件中包含多个PWM，返回的Matrix对象的一个列表，其中的每个PWM。返回的PWMlog变换，使条目[，j]的矩阵表示的对数概率观察的转录因子结合位点的第i个位置中的第j列的碱基。


实例----------Examples----------


require("rtfbs")
exampleArchive <- system.file("extdata", "NRSF.zip", package="rtfbs")
pwmFile <- "pwm.meme"
unzip(exampleArchive, pwmFile)
# Read in Position Weight Matrix (PWM) from MEME file from[阅读中的位置权重矩阵（PWM）MEME文件]
#  the examples into a Matrix object[到Matrix对象的例子]
pwm <- read.pwm(pwmFile)
# Print PWM as an R matrix[打印PWM R矩阵]
print(pwm)

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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