R语言 affycoretools包 annBM()函数中文帮助文档(中英文对照)

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annBM(affycoretools)
annBM()所属R语言包：affycoretools

                                        Select Available Annotation from a Biomart
                                         从Biomart选择可用的注释

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

These functions are designed to do two things that are useful for an end user. If called with no arguments, they will output a character vector of annotation sources that are typically available from a Biomart database. If called with a 'mart' connection (typically created by a call to useMart), they will return a character vector of annotation sources that exist for that particular Biomart and species. If called with a 'mart' connection and a character vector of annotation sources, they will return a list that is intended to be used by other functions for creating HTML pages. This last function doesn't have any real utility for the end user.
这些功能设计做两件事情，是为最终用户有用。如果不带参数的要求，他们将输出的特征向量通常从Biomart数据库标注来源。如果称为“集市”连接（通常由调用创建useMart），他们将返回一个标注来源为该的特别Biomart和物种存在的特征向量。如果称为“集市”的连接和注释来源的特征向量，他们将返回一个名单，拟由其他功能用于创建HTML页。这最后一个功能，没有任何最终用户的实际效用。


用法----------Usage----------


linksBM(mart, annot, affyid = FALSE, ann.source = NULL)



参数----------Arguments----------

参数：mart
A 'mart' connection, typically created by a call to useMart.
一个“集市”的连接，通常调用useMart由创建。


参数：annot
A character vector of annotation sources. This is not typically useful for an end user to specify.
注释来源的一个特征向量。这不是典型的为最终用户指定的有用。


参数：affyid
Boolean. Are the IDs being annotated Affymetrix IDs?
布尔值。注明Affymetrix公司的ID的ID吗？


参数：ann.source
Character. The filter name to use if we are annotating Affymetrix IDs.
字符。如果我们注释Affymetrix公司的ID过滤器的名称，使用。


参数：species
A species name, of the form e.g., 'hsapiens'
一个物种的名称，形式，例如，“hsapiens”


Details

详情----------Details----------

The purpose of these functions is to either give an example of typical annotation sources that may be available at a particular Biomart, or to output those sources that are known to exist at a Biomart.
这些功能的目的是给出一个典型的注解来源，可能是在一个特定的Biomart，或输出那些已知的来源存在于Biomart的例子。

linksBM is intended to list those annotation sources that may be turned into hyperlinks whereas annBM is intended to list those annotation sources that will not be linked.
linksBM旨在列出那些可能到了，而超链接标注来源annBM旨在列出那些不会被链接的标注来源。

These functions have only a few of the possible annotation sources, and currently there is no simple way to extend these sources. Additions to the list are possible, however. Please contact me if there is something in particular that should be included in either list.
这些功能有几个可能的标注来源，目前还没有简单的方法来延长这些来源。添置的列表是可能的，但是。请与我联系，如果有特别的东西，应包括在任一列表。


值----------Value----------

Normally called by an end user to output a character vector of annotation sources.
最终用户通常被称为输出一个注释来源的特征向量。


作者（S）----------Author(s)----------



James W. MacDonald <jmacdon@med.umich.edu>




举例----------Examples----------


annBM()

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。