R语言 rtfbs包 groupByGC.ms()函数中文帮助文档(中英文对照)

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groupByGC.ms(rtfbs)
groupByGC.ms()所属R语言包：rtfbs

                                        Group sequences by GC
                                         组序列的GC

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Group sequences in an MS object by their GC content.
组序列，其GC含量的MS对象。


用法----------Usage----------


  groupByGC.ms(ms, ngroups)



参数----------Arguments----------

参数：ms
MS object, containing at least ngroups sequences.
MS对象，含有至少NGROUPS序列。


参数：ngroups
Number of quantiles to group sequences into.
组序列插入号码的位数。


值----------Value----------

List of MS objects, where element i represents the i'th quantile according to GC content.
列表的MS的对象，，其中元素i表示第i个位数根据GC内容的。


参见----------See Also----------

read.ms
read.ms


实例----------Examples----------


require("rtfbs")
exampleArchive <- system.file("extdata", "NRSF.zip", package="rtfbs")
seqFile <- "input.fas"
unzip(exampleArchive, seqFile)
# Read in FASTA file "input.fas" from the examples into an [阅读在FASTA的文件“input.fas”中的例子成]
#   MS (multiple sequences) object[多个序列（MS）对象]
seqs <- read.ms(seqFile)
# Group sequences from the "seqs" MS object based on each [基于每个从“seqs”MS对象组序列]
#   sequences's GC content into 4 new MS objects, one for[到4个新的MS对象，一个序列的GC含量]
#   each GC content range[每个GC含量范围]
groups <- groupByGC.ms(seqs, 4)
sapply(groups, length)
sapply(groups, function(x) {range(gcContent.ms(x))})

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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