R语言 affycomp包 assessSpikeIn2()函数中文帮助文档(中英文对照)

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assessSpikeIn2(affycomp)
assessSpikeIn2()所属R语言包：affycomp

                                        New Assessment functions for Spike In Data
                                         穗新的评估功能，在数据

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

These functions are assessment functions. Each takes an ExpressionSet and returns a list with necessary
这些功能是评估职能。每个ExpressionSet并返回必要的列表


用法----------Usage----------


assessSpikeIn2(s, method.name=NULL, verbose=TRUE)
assessSpikeInSD(exprset, method.name=NULL, span=1/3)
assessLS(exprset, method.name=NULL)
assessMA2(exprset, method.name=NULL)



参数----------Arguments----------

参数：s
An ExpressionSet containing expression measures for Affymetrix's spike-in experiment.
一个ExpressionSet含有表达Affymetrix公司的穗在实验措施。


参数：exprset
An ExpressionSet containing  expression measures for Affymetrix's spike-in experiment.
一个ExpressionSet含有表达Affymetrix公司的穗在实验措施。


参数：method.name
Name of expression measure being assessed.
表达措施的名称被评估。


参数：verbose
logical. If TRUE show messages.
逻辑。如果TRUE显示的消息。


参数：span
span used in call to loess.
跨度使用呼叫loess。


Details

详情----------Details----------

assessMA2 performs the assessment for the second MA-plot (Figure 1b), and assessLS performs the assessment for signal detection plot (Figure 4c). assessMA2 also performs assessments used by fold-change related plots (Figures 5a,b) and the ROC plots (Figures 5c,d,e). assessSpikeInSD is for the standard deviation assessment in Figure 2b. assessSpikeIn2 is a wrapper for all these and returns a list of lists.  
assessMA2执行第二次主图（图1b），assessLS进行评估的信号检测图（图4c）的评估。 assessMA2也执行相关图倍改变（图5A，B）和中华民国图（图5C，D，E）使用的评估。 assessSpikeInSD是在图2b的标准偏差评估。 assessSpikeIn2是所有这些的包装，并返回一个列表。


值----------Value----------

Lists with the necessary information to make the Figures.
必要的信息，使数字列表。


作者（S）----------Author(s)----------


Rafael A. Irizarry

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