R语言 affxparser包 readClfEnv()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

readClfEnv(affxparser)
readClfEnv()所属R语言包：affxparser

                                        Parsing a CLF file using Affymetrix Fusion SDK
                                         解析clf文件使用Affymetrix公司融合SDK

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function parses a CLF file using the Affymetrix Fusion SDK. CLF (chip layout) files contain information associating probe ids with chip x- and y- coordinates.
此功能解析clf文件，使用Affymetrix融合SDK。 （芯片布局的CLF）文件包含的信息关联芯片的x和y坐标探针IDS。


用法----------Usage----------


readClfEnv(file, readBody = TRUE)



参数----------Arguments----------

参数：file
character(1) providing a path to the CLF file to be input.
character(1)提供的CLF文件的路径输入。


参数：readBody
logical(1) indicating whether the entire file should be parsed (TRUE) or only the file header information describing the chips to which the file is releavant.
logical(1)整个文件是否应该被解析（TRUE）或只描述芯片文件是releavant的文件头信息。


值----------Value----------

An enviroment. The header element is always present; the remainder are present when readBody=TRUE.
一个环境。 header元素是始终存在的，其余的是目前的当readBody=TRUE。


参数：header
A list with information about the CLF file. The list contains elements described in the CLF file format document referenced below.
与信息有关的CLF文件列表。该列表包含在clf文件格式参考下面的文档中描述的元素。


参数：dims
A length-two integer vector of chip x- and y-coordinates.
长度两个芯片的整数向量x和y坐标。


参数：id
An integer vector of length prod(dims) containing probe identifiers.
整数向量的长度prod(dims)含探针标识符。


参数：x
An integer vector of length prod(dims) containing x-coordinates corresponding to the entries in id.
一个长度为整数向量prod(dims)含有X-坐标对应id条目。


参数：y
An integer vector of length prod(dims) containing y-coordinates corresponding to the entries in id.
一个长度为整数向量prod(dims)含有Y坐标对应id条目。


作者（S）----------Author(s)----------


Martin Morgan <a href="mtmorgan@fhcrc.org">mtmorgan@fhcrc.org</a>



参见----------See Also----------

https://www.affymetrix.com/support/developer/fusion/File_Format_CLF_aptv161.pdf describes CLF file content.
https://www.affymetrix.com/support/developer/fusion/File_Format_CLF_aptv161.pdf介绍，CLF文件的内容。

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。