Parsing a CLF file using Affymetrix Fusion SDK
解析clf文件使用Affymetrix公司融合SDK
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This function parses a CLF file using the Affymetrix Fusion SDK. CLF (chip layout) files contain information associating probe ids with chip x- and y- coordinates.
此功能解析clf文件,使用Affymetrix融合SDK。 (芯片布局的CLF)文件包含的信息关联芯片的x和y坐标探针IDS。
用法----------Usage----------
readClf(file)
参数----------Arguments----------
参数:file
character(1) providing a path to the CLF file to be input.
character(1)提供的CLF文件的路径输入。
值----------Value----------
An list. The header element is always present.
一个列表。 header元素是始终存在的。
参数:header
A list with information about the CLF file. The list contains elements described in the CLF file format document referenced below.
与信息有关的CLF文件列表。该列表包含在clf文件格式参考下面的文档中描述的元素。
参数:dims
A length-two integer vector of chip x- and y-coordinates.
长度两个芯片的整数向量x和y坐标。
参数:id
An integer vector of length prod(dims) containing probe identifiers.
整数向量的长度prod(dims)含探针标识符。
参数:x
An integer vector of length prod(dims) containing x-coordinates corresponding to the entries in id.
一个长度为整数向量prod(dims)含有X-坐标对应id条目。
参数:y
An integer vector of length prod(dims) containing y-coordinates corresponding to the entries in id.
一个长度为整数向量prod(dims)含有Y坐标对应id条目。
作者(S)----------Author(s)----------
Martin Morgan <a href="mtmorgan@fhcrc.org">mtmorgan@fhcrc.org</a>