R语言 affxparser包 readCelIntensities()函数中文帮助文档(中英文对照)

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readCelIntensities(affxparser)
readCelIntensities()所属R语言包：affxparser

                                         Reads the intensities contained in several Affymetrix CEL files
                                         读取几个Affymetrix公司CEL文件中所载的强度

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Reads the intensities of several Affymetrix CEL files (as opposed to readCel() which only reads a single file).
读取几个Affymetrix公司CEL文件（而不是readCel（）只读取一个单一的文件）的强度。


用法----------Usage----------


readCelIntensities(filenames, indices = NULL, ..., verbose = 0)



参数----------Arguments----------

参数：filenames
the names of the CEL files as a character vector.
作为一个字符向量CEL文件的名称。


参数：indices
a vector of which indices should be read. If the argument is NULL all features will be returned.
该指数应读的向量。如果参数是NULL的所有功能将被退回。


参数：...
Additional arguments passed to readCel().
额外的参数传递readCel（）的。


参数：verbose
an integer: how verbose do we want to be, higher means more verbose.
一个整数：如何详细，我们希望，意味着更多的详细。


Details

详情----------Details----------

The function will initially allocate a matrix with the same memory footprint as the final object.
最初，该函数将分配矩阵具有相同的内存占用为最终目标。


值----------Value----------

A matrix with a number of rows equal to the length of the indices argument (or the number of features on the entire chip), and a number of columns equal to the number of files. The columns are ordered according to the filenames argument.
indices参数（或对整个芯片的功能），文件的数量等于列的长度等于行矩阵。列是有序的根据filenames论点。


注意----------Note----------

Currently this function builds on readCel(), and simply calls this function multiple times. If testing yields sufficient reasons for doing so, it may be re-implemented in C++.
目前此功能的基础上readCel（），只是简单地调用这个函数多次。如果测试产生足够的理由这样做，它可能会被重新实现在C + +。


作者（S）----------Author(s)----------



James Bullard, <a href="mailto:bullard@stat.berkeley.edu">bullard@stat.berkeley.edu</a> and
Kasper Daniel Hansen, <a href="mailto:khansen@stat.berkeley.edu">khansen@stat.berkeley.edu</a>




参见----------See Also----------

readCel() for a discussion of a more versatile function, particular with details of the indices argument.
readCel（）为一个更灵活的功能，尤其是与indices参数的细节进行讨论。


举例----------Examples----------


  # Scan current directory for CEL files[CEL文件扫描当前目录]
  files <- list.files(pattern="[.](c|C)(e|E)(l|L)$")
  if (length(files) >= 2) {
    cel <- readCelIntensities(files[1:2])
    str(cel)
    rm(cel)
  }

  # Clean up[清理]
  rm(files)

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