找回密码
 注册
查看: 2322|回复: 0

R语言 ACME包 write.bedGraph()函数中文帮助文档(中英文对照)

[复制链接]
发表于 2012-2-25 11:02:50 | 显示全部楼层 |阅读模式
write.bedGraph(ACME)
write.bedGraph()所属R语言包:ACME

                                        Write bedGraph format tracks for UCSC genome browser
                                         写bedGraph UCSC基因组浏览器格式轨道

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Generate bedGraph format files for the UCSC genome browser.  This function will write the bedGraph files associated with a aGFFcalc object.  There will be either one or two files (default two) representing the raw data and the calculated data (which is output as -log10(val) for visualization purposes for EACH sample).  
UCSC基因组浏览器产生bedGraph格式的文件。此功能会写的bedGraph与aGFFcalc对象关联的文件。会有一个或两个文件(默认两个)代表的原始数据和计算的数据(这是输出作为LOG10(VAL),每个样品的可视化的目的)。


用法----------Usage----------


write.bedGraph(x, raw = TRUE, vals = TRUE, directory = ".")



参数----------Arguments----------

参数:x
An ACMESet or ACMECalcSet object
一个ACMESet或ACMECalcSet对象


参数:raw
Boolean.  Create a file for the raw data?
布尔值。创建一个原始数据文件吗?


参数:vals
Boolean.  Create a file for the calculated p-values?
布尔值。创建一个计算p值的文件?


参数:directory
Give a directory for storing the files
给一个目录用于存储文件


作者(S)----------Author(s)----------


Sean Davis



举例----------Examples----------


data(example.agff)
write.bedGraph(example.agff)

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
回复

使用道具 举报

您需要登录后才可以回帖 登录 | 注册

本版积分规则

手机版|小黑屋|生物统计家园 网站价格

GMT+8, 2025-1-22 20:47 , Processed in 0.031246 second(s), 15 queries .

Powered by Discuz! X3.5

© 2001-2024 Discuz! Team.

快速回复 返回顶部 返回列表