R语言 aCGH包 threshold.func()函数中文帮助文档(中英文对照)

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threshold.func(aCGH)
threshold.func()所属R语言包：aCGH

                                        Function to indicate gain or loss for each clone for each sample
                                         功能，可显示每个样品每个克隆的收益或损失

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function outputs a matrix containing gain/loss indicator for each clone and sample.
这个函数输出一个矩阵，其中包含每个克隆和样品的收益/亏损指标。


用法----------Usage----------


threshold.func(dat, posThres, negThres = NULL)



参数----------Arguments----------

参数：dat
log2ratios of the relevant array CGH object
有关阵列全息对象log2ratios


参数：posThres
Global or sample-specific threshold for gain
全球或样本特定的阈值增益


参数：negThres
Global or sample-specific threshold for loss. Defaults to -posThres
全球或样本特定阈值的损失。默认为-posThres


值----------Value----------

Returns a matrix with a row for each clone and column for each sample. "1" indicates gain and "-1" indicates loss.
返回每个样品每个克隆和列与行的矩阵。 “1”表示增益和“-1”表示损失。


作者（S）----------Author(s)----------


Jane Fridlyand, Ritu Roydasgupta



举例----------Examples----------



data(colorectal)

factor <- 3
tbl <- threshold.func(log2.ratios(colorectal),posThres=factor*(sd.samples(colorectal)$madGenome))
rownames(tbl) <- clone.names(colorectal)
colnames(tbl) <- sample.names(colorectal)
tbl[1:5,1:5]


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注：
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