R语言 rphast包 sample.msa()函数中文帮助文档(中英文对照)

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sample.msa(rphast)
sample.msa()所属R语言包：rphast

                                        Sample columns from an MSA...
                                         从MSA的样品列...

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Sample columns from an MSA
从MSA的范例列


用法----------Usage----------





参数----------Arguments----------

参数：x
An object of type msa
的对象类型msa，


参数：size
The number of columns to sample
的列的数目来样


参数：replace
Whether to sample with replacement
无论是品尝与更换


参数：prob
A vector of probability weights for sampling each column; prob=NULL implies equal probability for all columns.  Probabilities need not sum to one but should be non-negative and can not all be zero.
一个向量的概率权重采样的每一列，“prob=NULL意味着对所有列的概率相等。概率并不需要总结，但应该是一个非负的，不能全部是零。


参数：pointer.only
If TRUE, return only a pointer to an alignment object stored in C (useful for large objects; advanced use only).
如果TRUE，只返回一个指针对齐对象（用于大对象存储在C，先进的使用）。


值----------Value----------

An object of type msa with columns randomly
对象类型msa列随机


注意----------Note----------

This function is implemented using R's sample function in conjunction with "[.msa".  It will not alter the value of x even if it
“MSA”结合使用R的示例函数，这个函数实现。它不会改变x的值，即使它


（作者）----------Author(s)----------


Melissa J. Hubisz and Adam Siepel



实例----------Examples----------


require("rphast")
m <- msa(seqs=c("AAAAAAAAAACCCCCGGT", "GGGGGGGGGGTTTTTCCA", "CCCCCCCCCCAAAAAGGA"),
         names=c("human", "mouse", "rat"))
sample.msa(m, 10, replace=TRUE)
sample.msa(m, 10, replace=TRUE, prob=c(rep(1, 10), rep(2, 5), rep(5, 2), 10))

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