R语言 rphast包 as.track.feat()函数中文帮助文档(中英文对照)

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as.track.feat(rphast)
as.track.feat()所属R语言包：rphast

                                        Create a features track...
                                         创建一个功能赛道...

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Create a features track
创建一个功能跟踪


用法----------Usage----------





参数----------Arguments----------

参数：x
An object of type feat
的对象类型feat，


参数：name
The name of the track (a character string)
的轨道的名称（字符串）


参数：short.label
An optional character string to be displayed in left hand margin of track
一个可选的字符要显示的字符串中左边边缘的轨道


参数：col
The color to use plotting this track (can be a single color or a color for each element)
要使用的颜色绘制这条轨道（可以是一个单一的颜色或颜色的每个元素）


参数：is.gene
A logical value; if TRUE, extract and plot gene information from features.  The features which will be plotted are the ones with types "CDS", "exon", or "intron".  All others will be ignored.
一个逻辑值，如果TRUE，提取物和图基因信息功能。这将被绘制的功能是与类型“CDS”，“外显子”，或“内含子”的那些。所有其他类型将被忽略。


参数：arrow.density
(Only used if is.gene==TRUE.  The number of lines per inch used to denote strand in gene plots.
如果is.gene==TRUE。（仅用于每英寸线数，用来表示链的基因图的数量。


值----------Value----------

An object of type track which can be plotted with plot.track
类型的对象可以绘制与track，plot.track


（作者）----------Author(s)----------


Melissa J. Hubisz



实例----------Examples----------


exampleArchive <- system.file("extdata", "examples.zip", package="rphast")
featFile <- "sol1.gp"
unzip(exampleArchive, featFile)
f <- read.feat(featFile)
featTrack <- as.track.feat(f, "basic feature track")
f <- add.introns.feat(f)
geneTrack <- as.track.feat(f, "gene track", is.gene=TRUE)
plot.track(list(featTrack, geneTrack))
plot.track(list(featTrack, geneTrack, geneTrack, geneTrack, geneTrack),
           xlim=c(14800, 16000))

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