groupkm(rms)
groupkm()所属R语言包：rms
Kaplan-Meier Estimates vs. a Continuous Variable
Kaplan-Meier估计与连续变量
译者：生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Function to divide x (e.g. age, or predicted survival at time u created by survest) into g quantile groups, get Kaplan-Meier estimates at time u (a scaler), and to return a matrix with columns x=mean x in quantile, n=number of subjects, events=no. events, and KM=K-M survival at time u, std.err = s.e. of -log K-M. Confidence intervals are based on -log S(t). Instead of supplying g, the user can supply the minimum number of subjects to have in the quantile group (m, default=50). If cuts is given (e.g. cuts=c(0,.1,.2,...,.9,.1)), it overrides m and g. Calls Therneau's survfitKM in the survival package to get Kaplan-Meiers estimates and standard errors.
功能划分x（如年龄，或预测生存时间u创建的survest）到g位数组，Kaplan-Meier估计在u （缩放），并返回一个矩阵的列x=x中位数，n=多个科目，events=。事件，和KM= KM生存时间u，std.err= SE的logK-M。 -log的S（t）的基础上的置信区间。而是提供g，用户可以提供的最低人数的受试者中位数组（m，默认值= 50）。 cuts如果给定的（如：cuts=c(0,.1,.2,...,.9,.1)），它覆盖m和g。调用Therneau的survfitKMsurvival包的Kaplan-Meiers的估算和标准错误。
用法----------Usage----------
groupkm(x, Srv, m=50, g, cuts, u,
pl=FALSE, loglog=FALSE, conf.int=.95, xlab, ylab,
lty=1, add=FALSE, cex.subtitle=.7, ...)
参数----------Arguments----------
参数：x
variable to stratify
变量进行分层
参数：Srv
a "Surv" object - n x 2 matrix containing survival time and event/censoring 1/0 indicator. Units of measurement come from the "units" attribute of the survival time variable. "Day" is the default.
一个“幸存者”对象 - NX 2基质中含有的生存时间和事件/审查1/0指标。计量单位从“单位人”的生存时间变量的属性。 “日”是默认的。
参数：m
desired minimum number of observations in a group
所需的最小数量的基团中的观察
参数：g
number of quantile groups
位数组的数量
参数：cuts
actual cuts in x, e.g. c(0,1,2) to use [0,1), [1,2].
实际削减的x，例如c(0,1,2)使用[0,1），[1,2]。
参数：u
time for which to estimate survival
估计生存时间
参数：pl
TRUE to plot results
TRUE图示结果
参数：loglog
set to TRUE to plot log(-log(survival)) instead of survival
设置为TRUE绘制log(-log(survival))，而不是生存
参数：conf.int
defaults to .95 for 0.95 confidence bars. Set to FALSE to suppress bars.
默认为.95为0.95的信心条形。设置为FALSE抑制条形。
参数：xlab
if pl=TRUE, is x-axis label. Default is label(x) or name of calling argument
如果pl=TRUE，X轴标签。默认值是label(x)或名称的调用参数
参数：ylab
if pl=TRUE, is y-axis label. Default is constructed from u and time units attribute.
如果pl=TRUE，Y轴标签。 u和时间units属性的默认构造。
参数：lty
line time for primary line connecting estimates
主线路连接的估计行时间
参数：add
set to TRUE if adding to an existing plot
设置为TRUE，如果加入到现有的图
参数：cex.subtitle
character size for subtitle. Default is .7. Use FALSE to suppress subtitle.
字幕的字符大小。默认是.7。使用FALSE抑制字幕。
参数：...
plotting parameters to pass to the plot and errbar functions
绘图参数传递给的图和errbar功能
值----------Value----------
matrix with columns named x (mean predictor value in interval), n (sample size in interval), events (number of events in interval), KM (Kaplan-Meier estimate), std.err (standard error of -log KM)
矩阵的列名为x（平均预测值在间隔），n（样本大小间隔），events（事件的时间间隔），KM（卡普兰， Meier估计值），std.err（标准错误logKM）
参见----------See Also----------
survfit, errbar, cut2, Surv, units
survfit，errbar，cut2，Surv，units
实例----------Examples----------
n <- 1000
set.seed(731)
age <- 50 + 12*rnorm(n)
cens <- 15*runif(n)
h <- .02*exp(.04*(age-50))
d.time <- -log(runif(n))/h
label(d.time) <- 'Follow-up Time'
e <- ifelse(d.time <= cens,1,0)
d.time <- pmin(d.time, cens)
units(d.time) <- "Year"
groupkm(age, Surv(d.time, e), g=10, u=5, pl=TRUE)
#Plot 5-year K-M survival estimates and 0.95 confidence bars by [图的5年KM生存的估计和0.95信心条形，]
#decile of age. If omit g=10, will have >= 50 obs./group.[等分的年龄。如果省略G = 10，> = 50的OBS /组。]
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注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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发表于 2012-9-27 19:11:09
