mixmodCluster(Rmixmod)
mixmodCluster()所属R语言包:Rmixmod
Create an instance of the [<a href="MixmodCluster-class.html">MixmodCluster</a>] class
创建一个实例[<a href="MixmodCluster-class.html"> MixmodCluster </ A>]类
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This function computes an optimal mixture model according to the criteria furnished, and the list of model defined in [Model], using the algorithm specified in [Strategy].
此功能根据提供的标准计算出一个最佳的混合模型,并在列表中定义的模型[Model],使用指定的算法[Strategy]。
用法----------Usage----------
mixmodCluster(data, nbCluster, dataType = NULL,
models = NULL, strategy = mixmodStrategy(),
criterion = "BIC", weight = NULL, knownLabels = NULL)
参数----------Arguments----------
参数:data
matrix or data frame containing quantitative or qualitative data. Rows correspond to observations and columns correspond to variables.
矩阵或数据框包含定量或定性的数据。行对应于观测值,列对应的变量。
参数:nbCluster
numeric listing the number of clusters.
数字列表的数字聚类。
参数:dataType
character. Type of data is either "quantitative" or "qualitative". Set as NULL by default, type will be guessed depending on variables type.
字符。数据类型是“定量”或“定性”。默认情况下,设置为NULL类型将被猜到根据变量类型。
参数:models
a [Model] object defining the list of models to run. For quantitative data, the model "Gaussian_pk_Lk_C" is called (see mixmodGaussianModel() to specify other models). For qualitative data, the model "Binary_pk_Ekjh" is called (see mixmodMultinomialModel() to specify other models).
一个[Model方向]对象定义列表模式运行。对于定量数据,的模式“Gaussian_pk_Lk_C”的被称为(见mixmodGaussianModel()来指定其他型号)。对于定性数据,的模式“Binary_pk_Ekjh”的被称为(看到mixmodMultinomialModel()到指定其他型号)。
参数:strategy
a [Strategy] object containing the strategy to run. Call mixmodStrategy() method by default.
一个[Strategy方向对象,其中包含的战略运行。默认情况下,调用mixmodStrategy()方法。
参数:criterion
list of character defining the criterion to select the best model. The best model is the one with the lowest criterion value. Possible values: "BIC", "ICL", "NEC", c("BIC", "ICL", "NEC"). Default is "BIC".
定义的标准字符列表,选择最佳的模型。最好的模型是一个最低标准值。可能的值:“BIC”,“ICL”,“NEC”,C(“BIC”,“ICL”,“NEC”)。默认值是“BIC”。
参数:weight
numeric vector with n (number of individuals) rows. Weight is optionnal. This option is to be used when weight is associated to the data.
与n的数值向量(个体数)行。重量optionnal。此选项时要使用的权重相关联的数据。
参数:knownLabels
vector of size nbSample. it will be used for semi-supervised classification when labels are known. Each cell corresponds to a cluster affectation.
矢量的大小nbSample。将被用于半监督的分类标签时是已知的。每个单元对应一个聚类做作。
值----------Value----------
Returns an instance of the [MixmodCluster] class. Those two
一实例[MixmodCluster类的返回。这两个
results a list of [MixmodResults] object containing all the results sorted in ascending order according to
[MixmodResults对象,它包含所有的结果按升序排序根据结果的列表
bestResult a S4 [MixmodResults] object containing
bestResult一个S4 [MixmodResults对象,其中包含
(作者)----------Author(s)----------
Remi Lebret and Serge Iovleff and Florent Langrognet,
with contributions from C. Biernacki and G. Celeux and G.
Govaert <a href="mailto:contact@mixmod.org">contact@mixmod.org</a>
实例----------Examples----------
## A quantitative example with the famous geyser data set[#A与著名的喷泉数据的定量例如设置]
data(geyser)
## with default values[#默认值]
mixmodCluster(geyser, nbCluster=2:6)
## An example with the birds data set[#例如,数据集的鸟类]
data(birds)
mixmodCluster(data=birds, nbCluster = 2:5, criterion= c("BIC","ICL","NEC"), model = mixmodMultinomialModel())
## use graphics functions[#使用的图形功能。]
xem <- mixmodCluster(data=geyser, nbCluster=3)
plot(xem)
hist(xem)
## get summary[#得到总结]
summary(xem)
转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。
注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
|