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新一代测序数据的数学模型和质量控制方法

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发表于 2011-8-22 17:13:20 | 显示全部楼层 |阅读模式
新一代测序数据的数学模型和质量控制方法
对三种最常用的国外新一代测序平台(Illumina/Solexa、Roche/454、AB/SOLiD)、我国自主研发的AG系列测序平台和将来的第三代测序,通过对实验环节中多种因素的分析,定量研究测序错误出现的规律和与之相关的因素,建立数据的误差模型,用以指导后续的数据处理算法。在此基础上,研究不同测序平台的特点,研究不同平台和不同应用的质量控制方法以及平台选择和优化组合方案。
在自主研发的AG系列新一代测序平台上,研究与测序编码技术相衔接的测序图像处理和碱基标识算法,结合上述误差模型和组合编码策略,建立我国自主知识产权的高通量测序原始数据处理算法和软件。同时,也将这些研究的成果反馈到测序技术研发中,推进测序技术本身的进步。
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