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课程班—基因组及生物信息学中的统计方法-病例-对照及连锁分析,北京, 2010年8

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发表于 2010-7-25 09:06:01 | 显示全部楼层 |阅读模式
本帖最后由 river 于 2010-7-25 09:09 编辑


基因组及生物信息学中的统计方法
病例-对照及连锁分析
北京, 2010年8月22日-27日

本课程的创办和组织者是中国科学院北京基因组研究所,统计遗传学实验室

Jurg Ott
博士







本次在中国 北京举办的实践培训课程已有较为悠久的历史,它始创于1988年,是Jurg Ott教授在美国哥伦比亚大学举办的首期该课程,每年举办一到两期,于1996年举办在美国的洛克菲勒大学其间,此课程的足迹遍布捷克斯洛伐克、芬兰、香港、韩国等国家和地区。今年,我们将继续进行实践培训课程,并将主题定位病例对照分析及连锁分析(2008年在北京举办的课程为理论教学课程,2009为首次实践培训课程)。

特别提示:本次课程中,参加者将会拿到真实数据,用于在整个课程中将学到的不同方法进行实际应用



本实践课程分理论教学和上机操作两部分。
学员要求自备操作系统为Windows  XP

windows 7或者其他的笔记本电脑



本课程理论部分为英文授课;实践部分有老师中文指导。
特别提示:本次课程中,参加者将会拿到真实数据,用于在整个课程中将学到的不同方法进行实际应用
以下是课程的初步安排。您也可以通过这里下载更详细的课程信息。






课程大纲


八月二十二日

注册报名
聚餐

八月二十三日

上午
课程简介,欢迎辞(Jurg Ott)
课程
00. Windows 命令行语言(Jurg Ott)
01. 关联分析介绍(Jurg Ott)
02. 群体遗传学基本介绍(Marcella Devoto)
03. 关联分析检验方法介绍(Derek Gordon)

下午
练习

04. 简单计算,检验的联系,包括allele freqencies, HWE等(Derek Gordon)
课程
05. 数据质量控制(Derek Gordon)
练习
06. PLINK软件培训(Marcella Devoto)
07. 利用PLINK进行数据质量控制(Derek Gordon)

八月二十四日

上午
课程
08. 关联分析—遗传模型,逻辑回归,协变量(Jurg Ott)
09. 群体分层(Derek Gordon)
练习
10. 利用MDS控制群体分层(Marcella Devoto)
11. TDT(Derek Gordon)

下午
课程

12. 多重检验控制,置换检验以及错误发现概率(Jurg Ott)
练习
13. 关联检验(Derek Gordon)
14. UCSC Genome Browser, HapMap and Haploview(Marcella Devoto)


八月二十五日

上午
课程
15. 连锁分析介绍(Marcella Devoto)
练习
16. 利用Merlin进行连锁分析练习(Marcella Devoto)

下午
由两部分组成:
1) 中文课程时间(内容待定),有关病例对照分析的答疑及练习(刘哲)
2) 自愿出行(长城等)


八月二十六日

上午
17. 基因群体分层分析(Derek Gordon)
18. 多位点分析,基因交互作用分析,利用Scan Statistics进行同质性分析
练习
19. 利用进行SumStat以及ScanStat软件进行基因交互作用分析

下午
课程

20. power分析(Derek Gordon)
练习
21. 应用Quanto进行power分析(Marcella Devoto)

八月二十七日

上午
课程
22. 应用PLINK分析CNV数据(Marcella Devoto)
23. 实际数据分析:Neuroblastoma data(Marcella Devoto)
练习
24. Neuroblastoma data(Marcella Devoto)

下午
讨论,分析参加课程人员提供的数据

学员报名请填写报名表
发送邮件至陈超或者Jurg Ott 邮箱。(下文附联系方式) (如有学术问题请与Jurg Ott 教授联系)我们将回复您的邮件,如3天内未收到回复,请来件询问。


  • 本课程注册费标准如下(注册费不包含食宿):


中国及其他发展中国家或地区学员(人民币):
学生            2600元
在职人员   

3600元

发达国家或地区学员(美元):
学生            600美元
在职人员      
1000美元

  • 联系方式:

     陈超
     Email: ChenChaoBig@yahoo.com
     联系电话/传真:010-8299 5385
     行动电话:
18701237130

Jurg Ott 教授
Email: [url=mailtottjurg@yahoo.com]ottjurg@yahoo.com[/url]


本课程将在北京快乐假日大酒店举办

北京快乐假日大酒店
位于有夏都之称的北京郊区延庆县龙庆峡风景区,是一家集住宿、餐饮、娱乐、会议、度假为一体的高档涉外三星级酒店,交通便利,设施齐备,是举办会议、观光旅游、休闲度假的理想场所。  酒店环境优美,空气清新,假山绿地,天然氧吧;背依连绵群山,后山攀顶观妫川胜景,夜晚望星空分外璀璨。酒店周边景区众多,风景秀丽。

电话: +86 10 8433 6001/02/03/04
中文网址: www.yanqinghotel.com

  • 行车路线:  


公交路线
乘坐919:
德胜门

延庆东关
换乘 920(龙庆峡线):

北京快乐假日大酒店

      
自驾
经八达岭高速按照路标行至龙庆峡景区即可找到快乐假日酒店


详细链接

http://www1.big.ac.cn/big/ott/Homecn.html
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