SCOP 蛋白质结构分类数据库

xiaoliu

蛋白质结构分类(SCOP)数据库详细描述了已知的蛋白质结构之间的关系。分类基
于若干层次：家族，描述相近的进化关系；超家族，描述远源的进化关系；折叠子
(fold)，描述空间几何结构的关系；折叠类，所有折叠子被归于全 α、全 β、α/β、α
＋β 和多结构域等几个大类。SCOP 还提供一个非冗余的 ASTRAIL 序列库，这个
库通常被用来评估各种序列比对算法。此外，SCOP 还提供一个 PDB-ISL 中介序列
库，通过与这个库中序列的两两比对，可以找到与未知结构序列远缘的已知结构序
列。
SCOP 的网址是：http://scop.mrc-lmb.cam.ac.uk/scop/。