traceplot(BioMark)
traceplot()所属R语言包:BioMark
Plot the coefficient or stability trace for the lasso/elastic net
绘制套索/弹力网的系数或稳定跟踪
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
The function plots the coefficient or stability traces for the lasso element of a BioMark object.
函数曲线的系数或稳定的一个生物标志物对象的套索元素的痕迹。
用法----------Usage----------
traceplot(object, ...)
参数----------Arguments----------
参数:object
An object of class BioMark.
对象的类BioMark。
参数:...
Further plotting arguments.
此外绘图参数。
(作者)----------Author(s)----------
Ron Wehrens
参考文献----------References----------
参见----------See Also----------
get.biom
get.biom
实例----------Examples----------
library(BioMark)
data(spikedApples)
mycols <- rep("gray", ncol(spikedApples$dataMatrix))
mycols[spikedApples$biom] <- "red"
myltys <- rep(2, ncol(spikedApples$dataMatrix))
myltys[spikedApples$biom] <- 1
par(mfrow = c(1,2))
apple.coef <- get.biom(X = spikedApples$dataMatrix,
Y = factor(rep(0:1, each = 10)),
ncomp = 2:3, type = "coef")
traceplot(apple.coef, col = mycols, lty = myltys)
apple.stab <- get.biom(X = spikedApples$dataMatrix,
Y = factor(rep(0:1, each = 10)),
fmethod = c("vip","lasso"), type = "stab")
traceplot(apple.stab, col = mycols, lty = myltys)
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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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