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R的基本画图函数非常容易学，看上去也很普通。然而适当的参数设置，有意义的颜色设置，不同基本图间的互相组合，会使你的图更漂亮也更有力的表达数据。下面介绍一些R基本包里画图函数的参数：
hist()： breaks设置每个柱的间距；freq柱图表示count或frequency；polt设置是否画图；density和angle可以设置柱上的斜线；axes设置是否需要画坐标轴； cor设置柱图的颜色；border设置柱图边界的颜色；xlim设置横轴范围；ylim设置纵轴范围。
R的许多函数都有类似的参数名，这些函数往往有同样的功能。因此后面就只介绍比较特殊的参数。
layout()：mat用矩阵设置窗口的划分，矩阵的0元素表示该位置不画图，非0元素必须包括从1开始的连续的整数值，比如：1……N，按非0元素的大小设置图形的顺序。widths用来设置窗口不同列的宽度，heights设置不同行的高度。par()的mfcol,和mfrow参数也有类似layout的功能，不过相对layout就逊色多了。
par()：mar设置图离四个边缘的距离；bg设置背景颜色；xaxt和yaxt设置坐标轴标签的类型（=”n”表示不画轴标签）；xlim和ylim设置坐标轴的范围。
axis()：las设置坐标轴标签的方式（水平，垂直……）。
mtext()：为四个坐标轴添加标签。
text()：在给定坐标的位置写字。
lines()：lty设置线的类型；lwd设置线的宽度。
points()：pch设置点的类型。
plot()：最简单的画图函数。type置画图的类型（type=”n”表示不画数据）；axes设置是否画坐标轴。常用的参数还有：xlim和ylim，xaxt和yaxt。
barplot()：space设置bar图间的间距；horiz设置bar的方向是垂直或水平；beside设置height为矩阵时，每列元素的bar排列方式；add设置是否将barplot加在当前已有的图上。
legend()：除了利用x,y设置图例的坐标外，用”topleft”， "center"，"bottomright"等设置位置非常方便。ncol设置图例的列数, horiz设置图例的排列方向。常有的参数还有col，lty，pch。
heatmap()：Rowv和Colv设置是否需要按行或列聚类；scale设置是否需要按行或列标准化；na.rm设置是否移去NA；RowSideColors和ColSideColors可以在行或列边缘添加颜色；keep.dendro设置是否画聚类树。
dendrogram()：'nodePar'和'edgePar'都是list，可以方便的设置节点和边的各种属性，如：颜色，样式，宽度，标签……。
在初学一个函数的时候，可能不知道函数有哪些参数，尤其是R中用...省略的参数。这时候看看“See Also:”里面提供的相关函数时非常有用的，R函数多是继承其它的更一半的函数，所以参数也会继承，理解了这一点，就能灵活应用..省略的参数了。另一方面，一些函数返回的对象的类是比较复杂的，有多个属性（一般会在“Value”里面说明这些对象的属性）。但有些函数的帮助里没有“Value”栏， 幸运的是R中的一些函数提供了对各种类通用的处理，通过这些函数你可以大概了解一个对象所有的属性。如：summary()总结对象的基本特征；attributes()列出对象的所有属性；attr()给出对象的指定属性的值；labels()列出对象的标签；str()展示对象的结构……。
http://rbbs.biosino.org/Rbbs/posts/list/197.page
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发表于 2010-6-25 02:22:15
