bayesglm.fit(BAS)
bayesglm.fit()所属R语言包:BAS
Fitting Generalized Linear Models Bayesian marginal likelihood evaluation
拟合广义线性模型贝叶斯边缘似然评价
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
A version of glm.fit rewritten in C; also returns marginal
的glm.fit在C重写的版本也返回边际
用法----------Usage----------
start = NULL, etastart = NULL,
mustart = NULL, offset = rep(0, nobs), family = binomial(),
coefprior = bic.prior(nobs),
control = glm.control(), intercept = TRUE)
参数----------Arguments----------
参数:x
design matrix
设计矩阵
参数:y
response
响应
参数:weights
optional vector of weights to be used in the fitting process. SHould be NULL or a numeric vector.
在嵌合过程中要使用可选的权重向量。应该是NULL或一个数值向量。
参数:start
starting value for coefficients in the linear predictor
的线性预测系数的初始值
参数:etastart
starting values for the linear predictor
线性预测器的初始值的
参数:mustart
starting values for the vectors of means
装置的向量的初始值
参数:offset
a priori known component to be included in the linear predictor
参数:family
a description of the error distribution and link function for exponential family; currently only binomial() is coded.
指数族的误差分布和链接功能的描述,目前只有二项式()的编码。
参数:coefprior
function specifying prior distribution on coefficients with optionlal hyperparamters leading to marginal likelihood calculations; options include bic.prior(), aic.prior(), and ic.prior()
指定先验分布的函数系数,optionlal hyperparamters边缘似然计算;选项包括bic.prior(), aic.prior()和ic.prior()
参数:control
a list of parameters that control convergence in the fitting process. See the documentation for glm.control()
在装修过程中的参数控制收敛的列表。请参阅文档glm.control()
参数:intercept
should an intercept be included in the null model?
应包括在空模型的拦截吗?
Details
详细信息----------Details----------
C version of glm-fit. For different prior choices returns, marginal likelihood of model using a Laplace approximation.
C版本的GLM拟合。对于不同的事先选择退货,使用拉普拉斯近似模型的边际可能性。
值----------Value----------
参数:coefficients
MLEs
最大似然估计
参数:se
Standard errors of coefficients based on the sqrt of the diagonal of the inverse information matrix
基于逆信息矩阵的对角线的sqrt系数的标准误差
参数:mu
fitted mean
合身的平均
参数:rank
numeric rank of the fitted linear model
拟合的线性模型的数字排名
参数:deviance
minus twice the log likelihood evaluated at the MLEs
减去两倍的评价在极大似然估计的对数似然
参数:g
value of g in g-priors
G-先验的g值
参数:shrinkage
shrinkage factor for coefficients in linear predictor
收缩系数为线性预测系数
参数:RegSS
quadratic form beta'I(beta)beta used in shrinkage
二次的形式betaI(测试)测试中使用的收缩
参数:logmarglik
the log marginal or integrated log likelihood (up to a constant)
边际或综合的log记录的可能性(一个常数)
(作者)----------Author(s)----------
Merlise Clyde translated the <code><a href="../../stats/html/glm.html">glm.fit</a></code> from R base
into C using the .Call interface
参考文献----------References----------
参见----------See Also----------
bic.prior
bic.prior
实例----------Examples----------
require(MASS)
library(MASS)
Pima.tr
Y = as.numeric(Pima.tr$type) - 1
X = cbind(1, as.matrix(Pima.tr[,1:7]))
out = bayesglm.fit(X, Y, family=binomial(),coefprior=bic.prior(n=length(Y)))
out$coef
# using built in function[使用内置的功能]
glm(type ~ ., family=binomial(), data=Pima.tr)
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