probeSelectionInterface(yaqcaffy)
probeSelectionInterface()所属R语言包：yaqcaffy
Tcltk Interface to Generate an Instance of YaqcControlProbes for a given Chip Set
tcltk接口生成的YaqcControlProbes的的的一个给定的芯片组的实例
译者：生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
probeSelectionInterface starts a tcltk graphical user interface (GUI) that allows the user to choose the probes to be used for subsequent quality analyses with the yaqcaffy package. The probes are selected on basis of the features of a given set of Affymetrix Genechips provided as input. The list of probes can be pre-filtered to display only control probes (i.e starting by AFFX) or all probes on the Genechip can be shown.
probeSelectionInterface启动一个的tcltk图形用户界面（GUI），允许用户选择yaqcaffy包后续质量分析用探针。 Affymetrix的基因芯片作为输入提供一个给定的功能基础上选择探针。探针名单可以预先过滤上显示的基因芯片只控制探针（即开始由AFFX）或所有探针可以显示。
用法----------Usage----------
probeSelectionInterface(object,
returnVar="yaqcControlProbes",
filter=TRUE)
参数----------Arguments----------
参数：object
an object of class AffyBatch or ExpressionSet.
类AffyBatch或ExpressionSet的对象。
参数：returnVar
a string defining the name of the variable the returned object will be saved as in the global environment. The default variable name is 'yaqcControlProbes'. If such a variable name already exists, a warning will be issued and the user can cancel the function.
定义一个字符串变量返回的对象的名称将被保存在全球环境。默认变量的名称是“yaqcControlProbes”。如果已经存在这样一个变量的名字，将发出警告，用户可以取消该功能。
参数：filter
logical value. If 'TRUE', the feature names of the input object are filtered out (see details). If 'FALSE', all features are listed for all control probes.
逻辑值。如果“TRUE”，输入对象的功能名称被过滤掉（见详情）。如果“假”，所有功能都列出了所有的控制探针。
Details
详情----------Details----------
Three tabs are displayed, one for the hybridization (bio) probes, labelling probes (dap, phe, thr and lys) and the degradation probes (actin and gapdh) respectively. If the user uses the 'Close' button, no return object is saved in the global environment. An object is saved as returnVar if the user presses 'Ok'. If such a variable name already exists, a warning will be issued and the user can close the interface and cancel the function.
显示三个选项卡，为杂交探针（生物），标记探针（DAP，苯丙氨酸，苏氨酸和赖氨酸）和降解探针（actin和GAPDH）分别之一。如果用户使用的“关闭”按钮，没有返回对象是在全球环境中保存。 returnVar如果用户按下“确定”保存对象。如果已经存在这样一个变量的名字，将发出警告，用户可以关闭接口，并取消该功能。
If filtering is applied, the hybridization menus will list probes that match the given probe (BioB, BioC or BioD) and position (5, 3 or M). Similarly, only matching labelling probes (dap, phe, thr and lys) and positions will be displayed. As the pattern for the degradation probes are less strict, all the 'AFFX' probes, except those already selected as hybridization and labelling probes, will be displayed in the drop-down menus.
如果应用于筛选，杂交菜单将列出探针，匹配给定的探针（BioB，BioC或biod）和位置（5，3或M）。同样，只有匹配标记探针（DAP，苯丙氨酸，苏氨酸和赖氨酸）和职位将被显示。作为降解探针的格局是不那么严格，所有“AFFX”除了那些已选定作为杂交和标记探针的探针，将显示在下拉菜单。
值----------Value----------
Returns an object of class YaqcBioProbes.
类YaqcBioProbes返回一个对象。
作者（S）----------Author(s)----------
Laurent Gatto
举例----------Examples----------
## Not run: [＃无法运行：]
library(affydata)
data(Dilution)
probeSelectionInterface(Dilution)
## End(Not run)[＃结束（不运行）]
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注：
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注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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发表于 2012-2-26 16:16:54
