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R语言 xmapbridge包 xmap.plot()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-26 16:15:57 | 显示全部楼层 |阅读模式
xmap.plot(xmapbridge)
xmap.plot()所属R语言包:xmapbridge

                                         Utility methods for quick graph generation
                                         快速的图形生成的实用方法

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

These methods attempt to provide a simpler interface for generating X:Map graphs.
这些方法尝试用于生成X提供了一个简单的界面:图图。


用法----------Usage----------


  xmap.plot( x, y, species=c("homo_sapiens","mus_musculus","rattus_norvegicus"),
             chr, xlim, ylim, main, sub,
             type=c("scatter", "line", "bar", "step", "area", "steparea"),
             xlab, ylab = "value", col, dp=2, projectid )
  xmap.points( x, y, type=c("scatter", "line", "bar", "step", "area", "steparea"),
             xlab, col, dp=2, graphid )



参数----------Arguments----------

参数:x
The points for the x-axis of this plot.  These points must be offsets from the start of the graph, and not their actual chromosomal location  
这个图的X-轴点。这些点必须从图开始偏移,而不是其实际的染色体定位


参数:y
The points for the y-axis of this plot.  Points where min>y or y >max will not be displayed  
这个图的Y轴点。分> Y或y>最大将不显示点


参数:species
The species that this graph is to be drawn on  
,这个图是要绘制的物种


参数:chr
A string representing the chromosome this graph is to be drawn on  
要绘制一个字符串,表示染色体图


参数:xlim
A range object describing the min and max BP for this graph.  If ommitted, we call range on the x parameter  
此图描述的最小和最大的BP一个范围对象。如果省略,我们称之为x参数范围


参数:ylim
The maximum and minimum Y value for the graph.  If ommitted, we call range on the y parameter  
图的最大和最小的Y值。如果省略,我们称之为y参数范围


参数:main
The main title  
主标题


参数:sub
A sub-title for this graph  
此图的一个副标题


参数:type
The type of graph you wish to draw  
你想画的图表类型


参数:xlab
The label for this plot  
这个图的标签


参数:ylab
The label for the yaxis of this graph  
这个图表的Y轴的标签


参数:col
The colour of the graph defined as an integer in the format 0xAARRGGBB.  See xmap.col  
图形的颜色定义为0xAARRGGBB格式的整数。看到xmap.col


参数:dp
The number of decimal places you want to save for the y-coordinates  
你要保存的y坐标的小数位数


参数:projectid
The projectid (returned by xmap.project.new and as a list from xmap.project.list.  If this is not passed, on the first time of calling a new project will be created, and will be used on all subsequent calls)  
的projectid(xmap.project.new“作为一个从xmap.project.list。如果不获通过,这是第一次调用一个新的项目将被创建,将被用于所有后续调用列表返回)


参数:graphid
The graphid returned by xmap.graph.new or xmap.graph.list.  If this is not passed, it will use the last graph generated by xmap.plot.  
的xmap.graph.new或xmap.graph.listgraphid返回。如果这是不获通过,它将使用xmap.plot产生最后的图形。


作者(S)----------Author(s)----------



Tim Yates




参见----------See Also----------

xmap.col<br> xmap.project.new<br> xmap.project.list<br> xmap.project.load<br> xmap.project.save<br> xmap.project.delete<br> xmap.graph.new<br> xmap.graph.list<br> xmap.graph.load<br> xmap.graph.save<br> xmap.graph.delete<br> xmap.plot.new<br> xmap.plot.list<br> xmap.plot.load<br> xmap.plot.save<br> xmap.plot.delete<br>
xmap.col参考xmap.project.new参考xmap.project.list参考xmap.project.load参考xmap.project.save参考xmap.project.delete参考xmap.graph.new参考xmap.graph.list参考xmap.graph.load参考xmap.graph.save参考xmap.graph.delete参考xmap.plot.new参考xmap.plot.list 参考xmap.plot.load参考xmap.plot.save参考xmap.plot.delete参考


举例----------Examples----------


  
  x <- seq( 1000, 100000, by = 1000 )
  y <- runif( length( x ), -10, 10 )

  # This will create a new project, and graph, and add a plot to it[这将创建一个新的项目,和图形,并添加一个图]
  xmap.plot( x, y, species="homo_sapiens", "1", main="A quick graph",
             sub="Sub heading", type="area", xlab="Plot 1", col=0xAAFFBB00 )

  # This will add another plot to the same graph[这将添加另一个图相同的图]
  xmap.points( x, y, type="area", xlab="Plot 2", col=0xAA0000FF )
  

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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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