zeroNu(XDE)
zeroNu()所属R语言包:XDE
Option for not modeling Nu
选项不建模怒江
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Nu is the average expression value in each study.
怒江是在每一个研究平均表现值。
用法----------Usage----------
zeroNu(object, ...)
参数----------Arguments----------
参数:object
object of class ExpressionSetList
对象类ExpressionSetList
参数:...
Not implemented
未实现
Details
详情----------Details----------
This function should be regarded as experimental.
此功能应被视为实验。
The nu parameter models the average expression value in each study. Modeling nu allows one to estimate differential expression across studies that may differ in location and scale (as often occurs when multiple platforms are used). The price to pay for modeling nu are additional assumptions (the nu\'s are assumed Gaussian) and a more heavily parameterized model.
怒江参数模型中平均每个研究表达式的值。 NU建模允许一个估计整个研究,可能会有所不同的位置和规模(如经常发生时,使用多个平台)的差异表达。建模NU付出的代价是额外的假设(NU \s的假设高斯)和更严重的参数化模型。
The method zeroNu allows one to fit the Bayesian model without estimating nu:
的的方法zeroNu允许一个适合贝叶斯模型估计NU:
- each gene is centered at zero
- 每个基因集中在零
- initial values for the first MCMC are chosen on the basis of empirical starting values
- 第一MCMC方法的初始值的经验值的基础上选择
- the initial values for a and rho are set to zero.
- 一个和Rho的初始值设置为零。
- the nu, a, gamma2, and rho parameters are not updated during MCMC
- 怒江,A,gamma2和rho参数不更新期间的MCMC
值----------Value----------
object of class XdeParameter
对象类XdeParameter
作者(S)----------Author(s)----------
R. Scharpf
参考文献----------References----------
Gene Expression, Technical Report 158, Johns Hopkins University, Department of Biostatistics
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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
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