xsScores(XDE)
xsScores()所属R语言包:XDE
Alternative cross-study scores of differential expression
替代的交叉研究分数差异表达
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Alternative cross-study scores of differential expression
替代的交叉研究分数差异表达
用法----------Usage----------
xsScores(statistic, N)
参数----------Arguments----------
参数:statistic
a matrix of study-specific estimates of effect size. Rows are genes and columns are studies.
规模效应的研究具体估计矩阵。行基因和列的研究。
参数:N
numerical vector: the number of samples in each study (the length should be the number of columns in statistic)
数值向量:在每个研究的样本数(长度应该列在statistic)
值----------Value----------
A matrix of cross-study scores for differential expression ("diffExpressed"), concordant differential expression, and discordant differential expression.
矩阵交叉研究成绩差(“diffExpressed”),表达差异表达一致,和不和谐的差异表达。
作者(S)----------Author(s)----------
R. Scharpf
参考文献----------References----------
microarray studies and modeling interstudy variation, Bioinformatics, 19(1) I84-I90.
(2007), Cross-study validation and combined analysis of gene expression microarray data, Biostatistics, September
Expression, Technical Report 158, Johns Hopkins University, Department of Biostatistics, 2007
参见----------See Also----------
the GeneMeta package, ssStatistic
GeneMeta包,ssStatistic
举例----------Examples----------
data(expressionSetList)
t <- ssStatistic(statistic="t", phenotypeLabel="adenoVsquamous", esetList=expressionSetList)
tScores <- xsScores(t, N=nSamples(expressionSetList))
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